RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	CNB1	P25296	175 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	OCH1	P31755	480 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	PAM17	P36147	197 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YEL028W	P39989	153 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	HUA1	P40325	198 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	FLX1	P40464	311 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	HOP2	P53187	214 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	MPC3	P53311	146 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SED1	Q01589	338 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	CWC27	Q02770	301 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	FMN1	Q03778	218 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SWC7	Q06707	132 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YNG1	Q08465	219 aa		0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	QCR7	P00128	127 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	ADE1	P27616	306 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	ARO7	P32178	256 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YEL067C	P39978	195 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GAT4	P40569	121 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	AIM34	Q03673	198 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	RAF1	Q06891	181 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	LDB18	Q07887	179 aa		0.62	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	COX8	P04039	78 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	CLG1	P35190	452 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YHL042W	P38729	150 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	VMA22	P38784	181 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YER121W	P40076	114 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YNL184C	P53876	108 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GIM3	P53900	129 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	NKP2	Q06162	153 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GTT2	Q12390	233 aa		0.61	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	MGT1	P26188	188 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SPC25	P40014	221 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	FIP1	P45976	327 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	TDA4	P47153	279 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	HHT1	P61830	136 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	VPS28	Q02767	242 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	MET31	Q03081	177 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.6	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	TIR1	P10863	254 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.59	□□□□□ -2.31	not detected
HIT1	YJR055W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	RAD51	P25454	400 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	AHT1	P29589	182 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	HSP150	P32478	413 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	RPB7	P34087	171 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SHG1	P38337	142 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	NSG1	P38837	291 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	AIM18	P38884	321 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	UBC12	P52491	188 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YNL033W	P53964	284 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YLR460C	P54007	376 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	DAD4	P69851	72 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	SHH4	Q06236	168 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	FIT2	Q08906	153 aa		0.59	□□□□□ -2.31
HIT1	YJR055W	YCR023C	P25351	611 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	HPA3	P39979	161 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	FMP32	P43557	207 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	YFL019C	P43576	117 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	SIP18	P50263	79 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	YET3	Q07451	203 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	HRD1	Q08109	551 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	FYV12	Q08559	129 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	DGK1	Q12382	290 aa		0.58	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	SEN2	P16658	377 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	STF2	P16965	84 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	HSP30	P25619	332 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	FES1	P38260	290 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	YFL065C	P43539	102 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	PGA1	P53896	198 aa		0.57	□□□□□ -2.32
HIT1	YJR055W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32

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