RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YNR040WP53736 256 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W GRE1Q08969 168 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W HAP3P13434 144 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YBL059WP34224 193 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W QDR3P38227 689 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W STS1P38637 319 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W MSY1P48527 492 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W CWC27Q02770 301 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W DFG5Q05031 458 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W NAT3Q06504 195 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W RFU1Q08003 200 aa8.86□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W SPS18P32572 300 aa8.85□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W FMO1P38866 432 aa8.85□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W TRM9P49957 279 aa8.85□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W FLO9P39712 1322 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YKL102CP34249 101 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YMR262WP38430 313 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W SHO1P40073 367 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W GEP7P53171 287 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W CRH1P53301 507 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YNL165WP53891 406 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W TVP18Q04767 167 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W NAT5Q08689 176 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YOR292CQ08743 309 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W AKR2Q12013 749 aa8.84□□□□□ -0.99
PRP4YPR178W YKL107WP34251 309 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W MIX23P38162 196 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W CYB5P40312 120 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W PCP1P53259 346 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W YPL077CQ02831 240 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W TRS23Q03784 219 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W YMR254CQ04838 102 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W YML053CQ04978 212 aa8.83□□□□□ -1
PRP4YPR178W FCY2P17064 533 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W SUA7P29055 345 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W YGR050CP53231 118 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W YMR007WQ03675 126 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W LOA1Q06508 300 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W NDE2Q07500 545 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W YFH1Q07540 174 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W YOR105WQ08504 108 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W ATG40Q99325 256 aa8.82□□□□□ -1
PRP4YPR178W YHR214C-DP0CX93 97 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W PAU16P35994 123 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W UBS1P38290 277 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W YIL169CP40442 995 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W YIP5P53108 310 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W SUN4P53616 420 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W MCH1Q07376 486 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W PAU23Q07987 124 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W HRD1Q08109 551 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W LDS2Q08218 356 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W YOL118CQ08259 102 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W SWT1Q12104 458 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W WTM2Q12206 467 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W PAU17Q12370 124 aa8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRP4YPR178W SAG1P20840 650 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W HMX1P32339 317 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W SOF1P33750 489 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W YKL187CP34231 750 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W DOG1P38774 246 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W DUG3P53871 357 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W YPL067CQ02754 198 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W ARR3Q06598 404 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W USV1Q12132 391 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W YOR192C-CQ3E736 78 aa8.8□□□□□ -1
PRP4YPR178W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data8.79□□□□□ -1not detected
PRP4YPR178W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W MSI1P13712 422 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W SRP21P32342 167 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W AME1P38313 324 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W YIL029CP40538 142 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W REE1P40893 198 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W PGU1P47180 361 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W RIM9Q04734 239 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W THI72Q08579 599 aa8.79□□□□□ -1
PRP4YPR178W ELF1P36053 145 aa8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W YER079WP40052 210 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W CFD1P40558 293 aa8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W IZH1Q03419 316 aa8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W YOL024WQ08172 172 aa8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRP4YPR178W CWP1P28319 239 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W DER1P38307 211 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W PCL7P40186 285 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W ARP3P47117 449 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W YGR151CP53287 111 aa8.77□□□□□ -1.01
PRP4YPR178W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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