RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	ERV29	P53337	310 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	ATG39	Q06159	398 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	ODC2	Q99297	307 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	SAL1	D6W196	494 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	URA3	P03962	267 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	FAR1	P21268	830 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	AST1	P35183	429 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	CIN4	P39110	191 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	YIL060W	P40519	144 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	FMP33	P46998	180 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	TDA4	P47153	279 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	FYV6	P53913	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	VPS63	O13549	108 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	QCR7	P00128	127 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	URA6	P15700	204 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	MIC26	P50087	233 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	HAL1	Q01766	294 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	HRD1	Q08109	551 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	CYC3	P06182	269 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.22	□□□□□ -1.73	not detected
SYF2	YGR129W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	MST28	P39552	234 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	RPR2	P40571	144 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	MST27	P53176	234 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SYF2	YGR129W	HIS3	P06633	220 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	SEN2	P16658	377 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	PHD1	P36093	366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YAR068W	P39564	161 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	TRM10	Q12400	293 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	AGC1	Q12482	902 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	CHO1	P08456	276 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	POP2	P39008	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	BNA6	P43619	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	IRC18	P47056	224 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	FMP42	Q04991	504 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YNG1	Q08465	219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	FMP23	P38231	175 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	DOG2	P38773	246 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	DOG1	P38774	246 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	VHT1	P53241	593 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	STP4	Q07351	490 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RAD28	Q12021	506 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	SIP1	P32578	815 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	UPS2	P35200	230 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RTT105	P40063	208 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	AIM20	P40451	204 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	MED4	Q12343	284 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RIB7	P33312	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	POR2	P40478	281 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	OTU1	P43558	301 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YGR042W	P53227	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	OCA2	P53949	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	MEH1	Q02205	184 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	SGF11	Q03067	99 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	FEX1	Q08913	375 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	FEX2	Q08991	375 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	UBA3	Q99344	299 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	CDS1	P38221	457 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	VMA22	P38784	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	MSS2	P40990	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	MAK3	Q03503	176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	VBA1	Q04301	562 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	VAM10	Q08474	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	TIM18	Q08749	192 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	RBD2	Q12270	262 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	MED11	Q99278	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYF2	YGR129W	CAP2	P13517	287 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	MIT1	P40002	666 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	YML018C	Q03730	393 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	GPN3	Q06543	272 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	ATG31	Q12421	196 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	RRT1	P38192	103 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYF2	YGR129W	SNF11	P38956	169 aa		4.14	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms