Protein–RNA interactions for Protein: P38192

RRT1, Regulator of rDNA transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1P38192 NSR1YGR159C 1245 nt16.23■□□□□ 0.19
RRT1P38192 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.11■□□□□ 0.17
RRT1P38192 NOP1YDL014W 984 nt15.66■□□□□ 0.1
RRT1P38192 MDJ1YFL016C 1536 nt14.52□□□□□ -0.08
RRT1P38192 YKL036CYKL036C 393 nt14.22□□□□□ -0.13
RRT1P38192 SRX1YKL086W 384 nt13.64□□□□□ -0.23
RRT1P38192 Q0297Q0297 156 nt13.6□□□□□ -0.23
RRT1P38192 YJL027CYJL027C 417 nt13.46□□□□□ -0.25
RRT1P38192 YCR051WYCR051W 669 nt12.89□□□□□ -0.35
RRT1P38192 SCS3YGL126W 1143 nt12.79□□□□□ -0.36
RRT1P38192 DBP2YNL112W 1641 nt12.75□□□□□ -0.37
RRT1P38192 YBR190WYBR190W 312 nt12.51□□□□□ -0.41
RRT1P38192 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.44□□□□□ -0.42
RRT1P38192 YOL085CYOL085C 342 nt12.28□□□□□ -0.44
RRT1P38192 CCC1YLR220W 969 nt12.26□□□□□ -0.45
RRT1P38192 RPP1BYDL130W 321 nt12.2□□□□□ -0.46
RRT1P38192 RTC3YHR087W 336 nt12.19□□□□□ -0.46
RRT1P38192 RVS167YDR388W 1449 nt12.07□□□□□ -0.48
RRT1P38192 PKP1YIL042C 1185 nt12.06□□□□□ -0.48
RRT1P38192 SCJ1YMR214W 1134 nt11.85□□□□□ -0.51
RRT1P38192 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.68□□□□□ -0.54
RRT1P38192 PET122YER153C 765 nt11.63□□□□□ -0.55
RRT1P38192 SHR5YOL110W 714 nt11.57□□□□□ -0.56
RRT1P38192 SCR1SCR1 522 nt11.54□□□□□ -0.56
RRT1P38192 PUT4YOR348C 1884 nt11.45□□□□□ -0.58
RRT1P38192 ATS1YAL020C 1002 nt11.38□□□□□ -0.59
RRT1P38192 YDJ1YNL064C 1230 nt11.35□□□□□ -0.59
RRT1P38192 URN1YPR152C 1398 nt11.33□□□□□ -0.6
RRT1P38192 RRN5YLR141W 1092 nt11.27□□□□□ -0.61
RRT1P38192 OPI9YLR338W 858 nt11.23□□□□□ -0.61
RRT1P38192 RPN10YHR200W 807 nt11.22□□□□□ -0.61
RRT1P38192 DEP1YAL013W 1218 nt11.21□□□□□ -0.61
RRT1P38192 ARE1YCR048W 1833 nt11.17□□□□□ -0.62
RRT1P38192 SAH1YER043C 1350 nt11.16□□□□□ -0.62
RRT1P38192 SSA3YBL075C 1950 nt11.13□□□□□ -0.63
RRT1P38192 YNL208WYNL208W 600 nt11.11□□□□□ -0.63
RRT1P38192 GAR1YHR089C 618 nt11.07□□□□□ -0.64
RRT1P38192 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.06□□□□□ -0.64
RRT1P38192 POA1YBR022W 534 nt11.06□□□□□ -0.64
RRT1P38192 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.05□□□□□ -0.64
RRT1P38192 RSB1YOR049C 1065 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT1P38192 PUN1YLR414C 792 nt10.95□□□□□ -0.66
RRT1P38192 BSC6YOL137W 1494 nt10.88□□□□□ -0.67
RRT1P38192 YJR018WYJR018W 363 nt10.81□□□□□ -0.68
RRT1P38192 BUD23YCR047C 828 nt10.78□□□□□ -0.68
RRT1P38192 PTC2YER089C 1395 nt10.77□□□□□ -0.68
RRT1P38192 TIR1YER011W 765 nt10.73□□□□□ -0.69
RRT1P38192 NAB2YGL122C 1578 nt10.7□□□□□ -0.7
RRT1P38192 SSA1YAL005C 1929 nt10.6□□□□□ -0.71
RRT1P38192 RPP2BYDR382W 333 nt10.59□□□□□ -0.71
RRT1P38192 PST2YDR032C 597 nt10.56□□□□□ -0.72
RRT1P38192 YJR120WYJR120W 351 nt10.53□□□□□ -0.72
RRT1P38192 DAL1YIR027C 1383 nt10.52□□□□□ -0.72
RRT1P38192 FIS1YIL065C 468 nt10.51□□□□□ -0.73
RRT1P38192 INM2YDR287W 879 nt10.49□□□□□ -0.73
RRT1P38192 SPT5YML010W 3192 nt10.46□□□□□ -0.73
RRT1P38192 FPR4YLR449W 1179 nt10.45□□□□□ -0.74
RRT1P38192 PHO4YFR034C 939 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT1P38192 YBL100CYBL100C 315 nt10.33□□□□□ -0.76
RRT1P38192 SRB2YHR041C 633 nt10.31□□□□□ -0.76
RRT1P38192 BDH2YAL061W 1254 nt10.31□□□□□ -0.76
RRT1P38192 YPS1YLR120C 1710 nt10.27□□□□□ -0.76
RRT1P38192 MEP2YNL142W 1500 nt10.25□□□□□ -0.77
RRT1P38192 SSA4YER103W 1929 nt10.21□□□□□ -0.77
RRT1P38192 YDR095CYDR095C 411 nt10.19□□□□□ -0.78
RRT1P38192 FUN26YAL022C 1554 nt10.18□□□□□ -0.78
RRT1P38192 WWM1YFL010C 636 nt10.18□□□□□ -0.78
RRT1P38192 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.18□□□□□ -0.78
RRT1P38192 YGR021WYGR021W 873 nt10.17□□□□□ -0.78
RRT1P38192 LSM3YLR438C-A 270 nt10.17□□□□□ -0.78
RRT1P38192 SHU1YHL006C 453 nt10.16□□□□□ -0.78
RRT1P38192 TRM9YML014W 840 nt10.15□□□□□ -0.78
RRT1P38192 ALF1YNL148C 765 nt10.12□□□□□ -0.79
RRT1P38192 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.11□□□□□ -0.79
RRT1P38192 YKL097CYKL097C 411 nt10.08□□□□□ -0.8
RRT1P38192 CCT6YDR188W 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
RRT1P38192 HOM6YJR139C 1080 nt10.06□□□□□ -0.8
RRT1P38192 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.05□□□□□ -0.8
RRT1P38192 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.05□□□□□ -0.8
RRT1P38192 DCW1YKL046C 1350 nt10.02□□□□□ -0.8
RRT1P38192 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.02□□□□□ -0.81
RRT1P38192 RPP2AYOL039W 321 nt10□□□□□ -0.81
RRT1P38192 YMR090WYMR090W 684 nt9.98□□□□□ -0.81
RRT1P38192 EMI2YDR516C 1503 nt9.95□□□□□ -0.82
RRT1P38192 SIS1YNL007C 1059 nt9.94□□□□□ -0.82
RRT1P38192 MNP1YGL068W 585 nt9.93□□□□□ -0.82
RRT1P38192 PTP1YDL230W 1008 nt9.92□□□□□ -0.82
RRT1P38192 RKM5YLR137W 1104 nt9.92□□□□□ -0.82
RRT1P38192 YDL221WYDL221W 552 nt9.88□□□□□ -0.83
RRT1P38192 CAC2YML102W 1407 nt9.84□□□□□ -0.83
RRT1P38192 YJL225CYJL225C 5277 nt9.83□□□□□ -0.84
RRT1P38192 BDF1YLR399C 2061 nt9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms