RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	OCH1	P31755	480 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PPQ1	P32945	549 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YKL187C	P34231	750 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RMD6	P39975	231 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GAT2	P40209	560 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GON7	P46984	123 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	OKP1	P53298	406 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	VBA1	Q04301	562 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YDR114C	Q04597	100 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SYM1	Q06563	197 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FCY22	Q12119	530 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PET20	Q99373	253 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RPL39	P04650	51 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YCR101C	P25607	182 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ACP1	P32463	125 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MID2	P36027	376 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SRL3	P36167	246 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	POP8	P38208	133 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YER121W	P40076	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YNL046W	P53956	172 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YPL067C	Q02754	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PRM15	Q03262	622 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	UPS1	Q05776	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	IRC25	Q07951	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ATG40	Q99325	256 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	UBA3	Q99344	299 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ARG80	P07249	177 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SEN2	P16658	377 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MRP17	P28778	131 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RPB7	P34087	171 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SLM1	P40485	686 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SOL1	P50278	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GMC1	Q04399	608 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SCP1	Q08873	200 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FRE8	Q12209	686 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MED4	Q12343	284 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PUT1	P09368	476 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	POP5	P28005	173 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	ECM25	P32525	599 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	COS8	P38723	381 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RRF1	P38771	230 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	CTR2	P38865	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
SLX1	YBR228W	NIF3	P53081	288 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	CAB5	Q03941	241 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FIT1	Q04433	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	LIP2	Q06005	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FEX2	Q08991	375 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YOR029W	Q12243	111 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SUA5	P32579	426 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	POP2	P39008	433 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	BMT5	P40493	336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YIL012W	P40551	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	PIR5	P46999	287 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	XPT1	P47165	209 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	SBH2	P52871	88 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	GEP7	P53171	287 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	HSK3	P69852	69 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	THI74	Q04083	370 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RIM9	Q04734	239 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	FEX1	Q08913	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	RFM1	Q12192	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	VAM3	Q12241	283 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SLX1	YBR228W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	QCR2	P07257	368 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	ACB1	P31787	87 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YUH1	P35127	236 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SLX1	YBR228W	YIR020C	P40575	100 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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