Protein–RNA interactions for Protein: P36144

UTP30, Ribosome biogenesis protein UTP30, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UTP30P36144 NSR1YGR159C 1245 nt17.19■□□□□ 0.34
UTP30P36144 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.86■□□□□ 0.29
UTP30P36144 NOP1YDL014W 984 nt16.36■□□□□ 0.21
UTP30P36144 MDJ1YFL016C 1536 nt16.11■□□□□ 0.17
UTP30P36144 YKL036CYKL036C 393 nt14.87□□□□□ -0.03
UTP30P36144 YJL027CYJL027C 417 nt14.74□□□□□ -0.05
UTP30P36144 SSA3YBL075C 1950 nt14.56□□□□□ -0.08
UTP30P36144 SRX1YKL086W 384 nt14.25□□□□□ -0.13
UTP30P36144 Q0297Q0297 156 nt14.21□□□□□ -0.13
UTP30P36144 DBP2YNL112W 1641 nt13.93□□□□□ -0.18
UTP30P36144 YBR190WYBR190W 312 nt13.92□□□□□ -0.18
UTP30P36144 RTC3YHR087W 336 nt13.56□□□□□ -0.24
UTP30P36144 YCR051WYCR051W 669 nt13.52□□□□□ -0.25
UTP30P36144 SCS3YGL126W 1143 nt13.39□□□□□ -0.27
UTP30P36144 PUT4YOR348C 1884 nt13.33□□□□□ -0.27
UTP30P36144 TRN1tP(UGG)A 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 SUF9tP(UGG)F 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 SUF8tP(UGG)H 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 SUF7tP(UGG)M 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13□□□□□ -0.33
UTP30P36144 CCC1YLR220W 969 nt12.87□□□□□ -0.35
UTP30P36144 YOL085CYOL085C 342 nt12.87□□□□□ -0.35
UTP30P36144 ARE1YCR048W 1833 nt12.83□□□□□ -0.35
UTP30P36144 RVS167YDR388W 1449 nt12.83□□□□□ -0.36
UTP30P36144 POA1YBR022W 534 nt12.83□□□□□ -0.36
UTP30P36144 SPT5YML010W 3192 nt12.82□□□□□ -0.36
UTP30P36144 RPP1BYDL130W 321 nt12.76□□□□□ -0.37
UTP30P36144 SSA4YER103W 1929 nt12.76□□□□□ -0.37
UTP30P36144 BSC6YOL137W 1494 nt12.72□□□□□ -0.37
UTP30P36144 PKP1YIL042C 1185 nt12.68□□□□□ -0.38
UTP30P36144 SCJ1YMR214W 1134 nt12.67□□□□□ -0.38
UTP30P36144 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.66□□□□□ -0.38
UTP30P36144 SAH1YER043C 1350 nt12.55□□□□□ -0.4
UTP30P36144 URN1YPR152C 1398 nt12.4□□□□□ -0.42
UTP30P36144 OPI9YLR338W 858 nt12.39□□□□□ -0.43
UTP30P36144 BDF1YLR399C 2061 nt12.38□□□□□ -0.43
UTP30P36144 BUD23YCR047C 828 nt12.27□□□□□ -0.45
UTP30P36144 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.23□□□□□ -0.45
UTP30P36144 SHR5YOL110W 714 nt12.22□□□□□ -0.45
UTP30P36144 PET122YER153C 765 nt12.19□□□□□ -0.46
UTP30P36144 TAT1YBR069C 1860 nt12.19□□□□□ -0.46
UTP30P36144 DEP1YAL013W 1218 nt12.16□□□□□ -0.46
UTP30P36144 PAC11YDR488C 1602 nt12.12□□□□□ -0.47
UTP30P36144 SCR1SCR1 522 nt12.06□□□□□ -0.48
UTP30P36144 MEP2YNL142W 1500 nt12.03□□□□□ -0.48
UTP30P36144 PTC2YER089C 1395 nt12.03□□□□□ -0.48
UTP30P36144 PUN1YLR414C 792 nt12□□□□□ -0.49
UTP30P36144 RPN10YHR200W 807 nt11.98□□□□□ -0.49
UTP30P36144 NAB2YGL122C 1578 nt11.96□□□□□ -0.49
UTP30P36144 ATS1YAL020C 1002 nt11.93□□□□□ -0.5
UTP30P36144 YDJ1YNL064C 1230 nt11.86□□□□□ -0.51
UTP30P36144 YNL208WYNL208W 600 nt11.86□□□□□ -0.51
UTP30P36144 DCW1YKL046C 1350 nt11.84□□□□□ -0.51
UTP30P36144 RRN5YLR141W 1092 nt11.83□□□□□ -0.52
UTP30P36144 NVJ2YPR091C 2313 nt11.82□□□□□ -0.52
UTP30P36144 FIS1YIL065C 468 nt11.77□□□□□ -0.53
UTP30P36144 YJR018WYJR018W 363 nt11.76□□□□□ -0.53
UTP30P36144 YBR220CYBR220C 1683 nt11.73□□□□□ -0.53
UTP30P36144 DAL1YIR027C 1383 nt11.66□□□□□ -0.54
UTP30P36144 YPS1YLR120C 1710 nt11.64□□□□□ -0.55
UTP30P36144 EMI2YDR516C 1503 nt11.64□□□□□ -0.55
UTP30P36144 GAR1YHR089C 618 nt11.61□□□□□ -0.55
UTP30P36144 FPR4YLR449W 1179 nt11.6□□□□□ -0.55
UTP30P36144 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.59□□□□□ -0.55
UTP30P36144 PHO4YFR034C 939 nt11.57□□□□□ -0.56
UTP30P36144 YMR090WYMR090W 684 nt11.57□□□□□ -0.56
UTP30P36144 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.55□□□□□ -0.56
UTP30P36144 RSB1YOR049C 1065 nt11.55□□□□□ -0.56
UTP30P36144 SDH1YKL148C 1923 nt11.5□□□□□ -0.57
UTP30P36144 PCH2YBR186W 1695 nt11.5□□□□□ -0.57
UTP30P36144 GUT2YIL155C 1950 nt11.48□□□□□ -0.57
UTP30P36144 YDL221WYDL221W 552 nt11.47□□□□□ -0.57
UTP30P36144 YJR120WYJR120W 351 nt11.47□□□□□ -0.57
UTP30P36144 YDR095CYDR095C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
UTP30P36144 INM2YDR287W 879 nt11.43□□□□□ -0.58
UTP30P36144 SEC11YIR022W 504 nt11.38□□□□□ -0.59
UTP30P36144 CAC2YML102W 1407 nt11.36□□□□□ -0.59
UTP30P36144 PIB2YGL023C 1908 nt11.32□□□□□ -0.6
UTP30P36144 SCC4YER147C 1875 nt11.3□□□□□ -0.6
UTP30P36144 PTP1YDL230W 1008 nt11.3□□□□□ -0.6
UTP30P36144 RPP2BYDR382W 333 nt11.27□□□□□ -0.61
UTP30P36144 TIR1YER011W 765 nt11.23□□□□□ -0.61
UTP30P36144 YBL100CYBL100C 315 nt11.21□□□□□ -0.61
UTP30P36144 RPP2AYOL039W 321 nt11.21□□□□□ -0.61
UTP30P36144 IRC15YPL017C 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
UTP30P36144 FPS1YLL043W 2010 nt11.19□□□□□ -0.62
UTP30P36144 SSA1YAL005C 1929 nt11.19□□□□□ -0.62
UTP30P36144 YSC84YHR016C 1407 nt11.15□□□□□ -0.62
UTP30P36144 GIS3YLR094C 1509 nt11.14□□□□□ -0.63
UTP30P36144 RTF1YGL244W 1677 nt11.13□□□□□ -0.63
UTP30P36144 YHL050CYHL050C 2094 nt11.08□□□□□ -0.63
UTP30P36144 PST2YDR032C 597 nt11.07□□□□□ -0.64
UTP30P36144 FUN26YAL022C 1554 nt11.06□□□□□ -0.64
UTP30P36144 ALF1YNL148C 765 nt11.04□□□□□ -0.64
UTP30P36144 UME6YDR207C 2511 nt11.01□□□□□ -0.65
UTP30P36144 PTK1YKL198C 1989 nt11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms