RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	TRS33	Q99394	268 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	HEM3	P28789	327 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	MNR2	P35724	969 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	BRN1	P38170	754 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RFC5	P38251	354 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	BDH2	P39713	417 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RTC4	P53850	401 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SRT1	Q03175	343 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VHS3	Q08438	674 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.08	□□□□□ -1.92	not detected
ECM29	YHL030W	DNM1	P54861	757 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	MSB4	Q12317	492 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	PSK1	P31374	1356 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CDC15	P27636	974 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SAS3	P34218	831 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CWH41	P53008	833 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	DSD1	P53095	428 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RMT2	Q03305	412 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CTF4	Q01454	927 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	OM45	P16547	393 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RTT107	P38850	1070 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RAD9	P14737	1309 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	DNF1	P32660	1571 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	NIP100	P33420	868 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SPO22	P40511	975 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ALG2	P43636	503 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CTF18	P49956	741 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CDC8	P00572	216 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SWE1	P32944	819 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	HOP2	P53187	214 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CSM3	Q04659	317 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	PSR2	Q07949	397 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	MRE11	P32829	692 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	HXT13	P39924	564 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SFB2	P53953	876 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SRC1	Q03707	834 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SWC3	P31376	625 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VID28	P40547	921 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CIR1	P42940	261 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	TCB1	Q12466	1186 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VTH1	P40438	1549 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VTH2	P40890	1549 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	KAR3	P17119	729 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	DPB3	P27344	201 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RKM3	P38222	552 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	NNF2	P53253	936 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	YNL144C	P53907	740 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	YHL017W	P38745	532 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RUP1	Q12242	671 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VPS41	P38959	992 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CST6	P40535	587 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	CTH1	P47976	325 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ELG1	Q12050	791 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	NKP1	Q12493	238 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RAD1	P06777	1100 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	HAP5	Q02516	242 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	VPS30	Q02948	557 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SPO19	Q03029	223 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	LAM6	Q08001	693 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ALE1	Q08548	619 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	JNM1	P36224	373 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SSP2	Q08646	371 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ATG9	Q12142	997 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	COQ4	O13525	335 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	MTF2	P10849	440 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	TOA1	P32773	286 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ECM29	YHL030W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92

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