RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	SWC3	P31376	625 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	UGA2	P38067	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	ALD3	P54114	506 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	DCD1	P06773	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	YJR008W	P47085	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	PKH1	Q03407	766 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNQ1	YCL028W	YLR271W	Q06152	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	BOI2	P39969	1040 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	CTI6	Q08923	506 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	SPO1	P53541	631 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	HPC2	Q01448	625 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RNQ1	YCL028W	TOS1	P38288	455 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	UBP12	P39538	1254 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	FCP1	Q03254	732 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	PSH1	Q12161	406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	ITC1	P53125	1264 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	HAT1	Q12341	374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNQ1	YCL028W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	HXT10	P43581	546 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	MTC5	Q03897	1148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	BDF2	Q07442	638 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNQ1	YCL028W	SPT21	P35209	758 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	BDP1	P46678	594 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	NCB2	Q92317	146 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	IRC3	Q06683	689 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	SAC3	P46674	1301 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	MSN5	P52918	1224 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	RPC31	P17890	251 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	PFF1	P38244	976 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	NKP2	Q06162	153 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	SLA1	P32790	1244 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNQ1	YCL028W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	EAF6	P47128	113 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	UBP16	Q02863	499 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	GYP5	Q12344	894 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	SIT4	P20604	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	CWH41	P53008	833 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	SAS4	Q04003	481 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	YKL222C	P35995	705 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	ERT1	P38140	529 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	DPH6	Q12429	685 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	PDR18	P53756	1333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	YGL242C	P53066	181 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	ERO1	Q03103	563 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	CDC16	P09798	840 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	ICP55	P40051	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	SRC1	Q03707	834 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	THI3	Q07471	609 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNQ1	YCL028W	CTT1	P06115	562 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	MGM1	P32266	881 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	MLC1	P53141	149 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	RAD50	P12753	1312 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	RMD1	Q03441	430 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	ADR1	P07248	1323 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	AI2	P03876	854 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	YNL193W	P53870	558 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	RRI2	Q12348	645 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	KIN4	Q01919	800 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	POM152	P39685	1337 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RNQ1	YCL028W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	KRE2	P27809	442 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	PMD1	P32634	1753 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	SPL2	P38839	148 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	GRX6	Q12438	231 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	MRPS35	P53292	345 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	UBX2	Q04228	584 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RNQ1	YCL028W	PIF1	P07271	859 aa		13.29	□□□□□ -0.28

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