RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M SOL1P50278 321 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TOS8P53147 276 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CRH1P53301 507 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M STD1Q02794 444 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YML122CQ03207 126 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR179W-AQ03983 463 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M LPP1Q04396 274 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MGR3Q04472 501 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M DPB4Q04603 196 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HOR7Q05827 59 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YPD1Q07688 167 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR031WQ07978 186 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX27Q08580 376 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG41Q12048 136 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M IES3Q12345 250 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M AAC1P04710 309 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PET54P10834 293 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SEN2P16658 377 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM10P18409 493 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M IFM1P25038 676 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RTG1P32607 177 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL075CP36083 450 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR197CP38306 217 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M IKI1P38874 309 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GET2P40056 285 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M DDI1P40087 428 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GVP36P40531 326 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HAM1P47119 197 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YML018CQ03730 393 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC23Q08416 157 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM4Q12498 284 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HUG1Q6Q5K6 68 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR365WQ7LIF2 110 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TDH1P00360 332 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GAL1P04385 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL9AP05738 191 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL3P14126 387 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC23P16522 626 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M STF2P16965 84 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ROX3P25046 220 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GAR1P28007 205 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YPS1P32329 569 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YUH1P35127 236 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M COS8P38723 381 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GEP4P38812 185 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M HPA3P39979 161 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MIT1P40002 666 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PHM8P40025 321 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M FCY21P40039 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG18P43601 500 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL118WP47022 219 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M BUL1P48524 976 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MSE1P48525 536 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP8P50102 471 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M COX18P53239 316 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM27P53305 110 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MEH1Q02205 184 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M NRG1Q03125 231 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M TDA1Q03533 586 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GRH1Q04410 372 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M ASM4Q05166 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL35Q06678 367 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR292CQ08743 309 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM3Q08931 133 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL199CQ08954 240 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SUS1Q6WNK7 96 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M QCR7P00128 127 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M URA3P03962 267 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR144CP34215 104 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M SRY1P36007 326 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GPX2P38143 162 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT31P38555 223 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M IMD2P38697 523 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M GOS1P38736 223 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M COX15P40086 486 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M BMT5P40493 336 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M RBL2P48606 106 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CPD1P53314 239 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)MtW(CCA)M CAB4P53332 305 aa2.05□□□□□ -2.08
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