RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K SOL1P50278 321 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TOS8P53147 276 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CRH1P53301 507 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K STD1Q02794 444 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YML122CQ03207 126 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR179W-AQ03983 463 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K LPP1Q04396 274 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MGR3Q04472 501 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K DPB4Q04603 196 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HOR7Q05827 59 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YPD1Q07688 167 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR031WQ07978 186 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX27Q08580 376 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG41Q12048 136 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K IES3Q12345 250 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K AAC1P04710 309 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PET54P10834 293 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SEN2P16658 377 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM10P18409 493 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K IFM1P25038 676 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RTG1P32607 177 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL075CP36083 450 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR197CP38306 217 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K IKI1P38874 309 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GET2P40056 285 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K DDI1P40087 428 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GVP36P40531 326 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HAM1P47119 197 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YML018CQ03730 393 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K IRC23Q08416 157 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM4Q12498 284 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HUG1Q6Q5K6 68 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR365WQ7LIF2 110 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TDH1P00360 332 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GAL1P04385 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL9AP05738 191 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPL3P14126 387 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC23P16522 626 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K STF2P16965 84 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ROX3P25046 220 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GAR1P28007 205 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YPS1P32329 569 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YUH1P35127 236 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K COS8P38723 381 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GEP4P38812 185 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K HPA3P39979 161 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MIT1P40002 666 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PHM8P40025 321 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K FCY21P40039 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG18P43601 500 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL118WP47022 219 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K BUL1P48524 976 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MSE1P48525 536 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K UBP8P50102 471 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K COX18P53239 316 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RSM27P53305 110 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MEH1Q02205 184 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K NRG1Q03125 231 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K TDA1Q03533 586 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GRH1Q04410 372 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K ASM4Q05166 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K MRPL35Q06678 367 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR292CQ08743 309 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K PRM3Q08931 133 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YPL199CQ08954 240 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SUS1Q6WNK7 96 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K QCR7P00128 127 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K URA3P03962 267 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YBR144CP34215 104 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K SRY1P36007 326 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GPX2P38143 162 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YPT31P38555 223 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K IMD2P38697 523 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K GOS1P38736 223 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K COX15P40086 486 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K BMT5P40493 336 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K RBL2P48606 106 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CPD1P53314 239 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)KtW(CCA)K CAB4P53332 305 aa2.05□□□□□ -2.08
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