RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J SOL1P50278 321 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J TOS8P53147 276 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J CRH1P53301 507 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J STD1Q02794 444 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YML122CQ03207 126 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR179W-AQ03983 463 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J LPP1Q04396 274 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MGR3Q04472 501 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J DPB4Q04603 196 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HOR7Q05827 59 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YPD1Q07688 167 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR031WQ07978 186 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX27Q08580 376 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG41Q12048 136 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J IES3Q12345 250 aa2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HTB1P02293 131 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J AAC1P04710 309 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PET54P10834 293 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J SEN2P16658 377 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM10P18409 493 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J IFM1P25038 676 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RTG1P32607 177 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL075CP36083 450 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR197CP38306 217 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HTD2P38790 280 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J IKI1P38874 309 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GET2P40056 285 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J DDI1P40087 428 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GVP36P40531 326 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HAM1P47119 197 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YML018CQ03730 393 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC23Q08416 157 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PRM4Q12498 284 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HUG1Q6Q5K6 68 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR365WQ7LIF2 110 aa2.07□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J TDH1P00360 332 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GAL1P04385 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL9AP05738 191 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL3P14126 387 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC23P16522 626 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J STF2P16965 84 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ROX3P25046 220 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GAR1P28007 205 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J TRR1P29509 319 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YPS1P32329 569 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YUH1P35127 236 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM33P38248 429 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J COS8P38723 381 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GEP4P38812 185 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J HPA3P39979 161 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MIT1P40002 666 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J SMB1P40018 196 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PHM8P40025 321 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J FCY21P40039 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG18P43601 500 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL118WP47022 219 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J BUL1P48524 976 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MSE1P48525 536 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP8P50102 471 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J COX18P53239 316 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM27P53305 110 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MEH1Q02205 184 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J NRG1Q03125 231 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA1Q03533 586 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GRH1Q04410 372 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J ASM4Q05166 528 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL35Q06678 367 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR292CQ08743 309 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J PRM3Q08931 133 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL199CQ08954 240 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J SUS1Q6WNK7 96 aa2.06□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J QCR7P00128 127 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J URA3P03962 267 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR144CP34215 104 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J SRY1P36007 326 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GPX2P38143 162 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT31P38555 223 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J IMD2P38697 523 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J GOS1P38736 223 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J COX15P40086 486 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J BMT5P40493 336 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS0BP46654 252 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J RBL2P48606 106 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J CPD1P53314 239 aa2.05□□□□□ -2.08
tW(CCA)JtW(CCA)J CAB4P53332 305 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms