RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	RFM1	Q12192	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	MED4	Q12343	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	BBP1	Q12365	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	TRM13	Q12383	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	BPH1	P25356	2167 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CIN4	YMR138W	RNP1	P32385	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	POP8	P38208	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	TTI2	P47168	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	STD1	Q02794	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	THI74	Q04083	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	CSI2	Q08054	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	QCR2	P07257	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	CKA1	P15790	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	MRP17	P28778	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	LAG1	P38703	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	IKI1	P38874	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YFL015C	P43578	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YHC3	P47040	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YGL114W	P53134	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RIM9	Q04734	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RTT103	Q05543	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	SCM3	Q12334	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	TFC7	Q12415	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RDI1	Q12434	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YMR31	P19955	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	REC104	P33323	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	ALG14	P38242	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	WSC2	P53832	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	IRC25	Q07951	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	LSB5	P25369	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RPB9	P27999	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	ERG2	P32352	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	BNA1	P47096	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YGL262W	P53054	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	MIX17	Q03667	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	CAB5	Q03941	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	HRD1	Q08109	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	ROX3	P25046	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	SUA5	P32579	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	SRL3	P36167	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	ECM31	P38122	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CIN4	YMR138W	IRC24	P40580	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	HED1	Q03937	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YPD1	Q07688	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YCT1	Q12235	531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	VPS63	O13549	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	DIT1	P21623	536 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RRF1	P38771	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	MEH1	Q02205	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	TMA10	Q06177	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	SWT1	Q12104	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	ISN1	Q99312	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	STF2	P16965	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	PMU1	P36069	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	PCL7	P40186	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	UBP8	P50102	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	YGR045C	P53229	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	APJ1	P53940	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	TSA2	Q04120	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	PRM4	Q12498	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CIN4	YMR138W	COQ2	P32378	372 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	SRY1	P36007	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ERV15	P38312	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	CUE1	P38428	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	PIC2	P40035	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YER188W	P40103	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	LPP1	Q04396	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	CCW14	O13547	238 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIN4	YMR138W	ADE8	P04161	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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