RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SWD3	P38123	315 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RFC2	P40348	353 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YIL029C	P40538	142 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	VPS28	Q02767	242 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YDR391C	Q04170	232 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YOL024W	Q08172	172 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YOL118C	Q08259	102 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	CKA1	P15790	372 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	IMP1	P28627	190 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPB7	P34087	171 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YMR262W	P38430	313 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SIP18	P50263	79 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPN14	P53196	417 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	ALG12	P53730	551 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YDR286C	Q05530	114 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YDL086W	Q07505	273 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	FRE8	Q12209	686 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YCT1	Q12235	531 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		5.23	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	ERG2	P32352	222 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	RPD3	P32561	433 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	CLB6	P32943	380 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PIG2	P40187	538 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	AGX1	P43567	385 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PHO23	P50947	330 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PKP2	P53170	491 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SKO1	Q02100	647 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YDR114C	Q04597	100 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	YPR098C	Q06089	161 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	PIN3	Q06449	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
YCK1	YHR135C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	LAG1	P38703	411 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	POP2	P39008	433 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	PAC2	P39937	518 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	EGT2	P42835	1041 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YFL051C	P43552	160 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	MRX5	P47007	382 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SNN1	P48232	102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SOL1	P50278	321 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YIP5	P53108	310 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YDL218W	Q07629	317 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	MET3	P08536	511 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YCR101C	P25607	182 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YEA6	P39953	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	XBP1	P40489	647 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	BUL1	P48524	976 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	UBC13	P52490	153 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	GPI15	P53961	229 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SWT1	Q12104	458 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ATG40	Q99325	256 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	MAK32	P23060	363 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	MEH1	Q02205	184 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YDC1	Q02896	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ODC1	Q03028	310 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CAC2	Q04199	468 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	API2	Q04413	109 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YMR254C	Q04838	102 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	TMA10	Q06177	86 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SPS4	P09937	338 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ERV15	P38312	142 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	GPI16	P38875	610 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SEN34	P39707	275 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YJR012C	P47087	207 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	MCM22	P47167	239 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	SRB7	P47822	140 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	TAF4	P50105	388 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YML108W	Q03759	105 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	FIT1	Q04433	528 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	ISN1	Q99312	450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YCK1	YHR135C	LNP1	P38878	278 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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