RNA–Protein interactions for RNA: YBR286W

APE3, Transcript of Vacuolar aminopeptidase Y, yeast

Gene APE3, Length 1,614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE3	YBR286W	ATP14	Q12349	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	ATG40	Q99325	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	PDC2	P32896	925 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	OSH7	P38755	437 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	RMD6	P39975	231 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	SRB7	P47822	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	INN1	P53901	409 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	SED1	Q01589	338 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	VPS28	Q02767	242 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	ISU1	Q03020	165 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	EST3	Q03096	181 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	CAC2	Q04199	468 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	ASM4	Q05166	528 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	UPS1	Q05776	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	AEP3	Q12089	606 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	FCY22	Q12119	530 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	YCT1	Q12235	531 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APE3	YBR286W	RPL39	P04650	51 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SPS100	P13130	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	LAG1	P38703	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PAC2	P39937	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SWM2	P40342	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	RFC2	P40348	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YGL117W	P53133	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	DID2	P69771	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	FIT1	Q04433	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	DAL80	P26343	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PRM5	P40476	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	IRC24	P40580	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SWT1	Q12104	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YUH1	P35127	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	HSK3	P69852	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	RIM9	Q04734	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	BPH1	P25356	2167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ISC10	P32645	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	CUE1	P38428	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ECM14	P38836	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SSO2	P39926	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	AGX1	P43567	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YJR012C	P47087	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	UBC12	P52491	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YGL262W	P53054	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	RFM1	Q12192	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	RPD3	P32561	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YKL107W	P34251	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ERV15	P38312	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	CTR2	P38865	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YEA6	P39953	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PCL7	P40186	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SLM1	P40485	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	BNA2	P47125	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	XPT1	P47165	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PKP2	P53170	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PEF1	P53238	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	GPI15	P53961	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	TIM44	Q01852	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	COA2	Q3E823	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	ISN1	Q99312	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	REC104	P33323	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	SPC29	P33419	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	YKL187C	P34231	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APE3	YBR286W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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