RNA–Protein interactions for RNA: YMR275C

BUL1, Transcript of Ubiquitin-binding component of the Rsp5p E3-ubiquitin ligase complex, yeast

Gene BUL1, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUL1	YMR275C	CKA1	P15790	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	IFM1	P25038	676 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	IMP1	P28627	190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	FAT1	P38225	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SSO2	P39926	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YIL029C	P40538	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	GWT1	P47026	490 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	PEX4	P29340	183 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	MNS1	P32906	549 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SEN34	P39707	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	BMT5	P40493	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	HNT2	P49775	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	VPS28	Q02767	242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ANT1	Q06497	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	MRS4	P23500	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SWD3	P38123	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	LAG1	P38703	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	PAC2	P39937	518 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YFL051C	P43552	160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	MRX5	P47007	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YIP5	P53108	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YGL117W	P53133	265 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	THI74	Q04083	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	FCY22	Q12119	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	COX17	Q12287	69 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	OSH7	P38755	437 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	PKP2	P53170	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SKO1	Q02100	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	MEH1	Q02205	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ATP14	Q12349	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ATG40	Q99325	256 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	GAL1	P04385	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	QCR2	P07257	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SPS4	P09937	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RPB7	P34087	171 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	FLO10	P36170	1169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RFC2	P40348	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	EGT2	P42835	1041 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	TIM44	Q01852	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YFH1	Q07540	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SWT1	Q12104	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	IRC24	P40580	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	TAF4	P50105	388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	SOL1	P50278	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	CRZ1	P53968	678 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YDC1	Q02896	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	AEP3	Q12089	606 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	FRE8	Q12209	686 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YCT1	Q12235	531 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YCK3	P39962	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	PCL7	P40186	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	AGX1	P43567	385 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	CAC2	Q04199	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YCR101C	P25607	182 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ERG2	P32352	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YBR220C	P38318	560 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	INN1	P53901	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ACS1	Q01574	713 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RIM9	Q04734	239 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	TOK1	P40310	691 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	XPT1	P47165	209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	ALG12	P53730	551 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	GRC3	Q07845	632 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUL1	YMR275C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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