RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR030WQ07967 263 aa0.21□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSB2P32334 1306 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q AQY2P0CD90 149 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q TVP38P36164 337 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR056CP47115 236 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPO19Q03029 223 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG39Q06159 398 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL257WQ08974 193 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCT1Q12235 531 aa0.2□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRX3P38172 270 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q THO1P40040 218 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL217WP40152 326 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRX5P47007 382 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q BOL2P53082 120 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q LSB1P53281 241 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUS2P53830 285 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRO2P54885 456 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG17Q06410 417 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa0.19□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSR1P13856 272 aa0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YSR3P23501 404 aa0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPT52P36018 234 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q MEP1P40260 492 aa0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q SOK1P40317 901 aa0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR172WQ06608 200 aa0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL180WQ12301 547 aa0.18□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWI1P09547 1314 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS3P23643 1011 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAA1P39012 614 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPI8P49018 411 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAY1P53324 424 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERV41Q04651 352 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSA1Q08471 629 aa0.17□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFC1P32367 649 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q JEN1P36035 616 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL070WP36087 169 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q DDI1P40087 428 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q PGD1P40356 397 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR012CP47087 207 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q ABZ2Q03266 374 aa0.16□□□□□ -2.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR104WP0CE69 306 aa0.15□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAR068WP39564 161 aa0.15□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q LCL2Q08045 131 aa0.15□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR186WQ08560 144 aa0.15□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q HTL1Q9URQ5 78 aa0.15□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPT7P35177 1332 aa0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET5P47169 1442 aa0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLH1P53327 1967 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET16P18408 261 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPF1P38805 295 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q EDC3P39998 551 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPA43P46669 326 aa0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR020W-AQ3E824 90 aa0.14□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNA15P25299 296 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL39P36533 70 aa0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q HAM1P47119 197 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIF1P52923 378 aa0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q GMC2Q06201 188 aa0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q COQ10Q08058 207 aa0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRP40Q08285 240 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q HIS1P00498 297 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC8P00572 216 aa0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q MEK1P24719 497 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM33P38248 429 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL065CP43539 102 aa0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNZ3P43545 298 aa0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP33P46998 180 aa0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAE1P47118 141 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q POP3P53833 195 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL160WQ08321 113 aa0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR139C-AO13536 103 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q IPP1P00817 287 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q EHD3P28817 500 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q QRI5P32344 111 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIP3P38717 1229 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YRB2P40517 327 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data0.11□□□□□ -2.39not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q ALG11P53954 548 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RCE1Q03530 315 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPG4Q04438 115 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q PGC1Q08959 321 aa0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q NIP7Q08962 181 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q BLI1P35727 113 aa0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS21P36017 210 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHL042WP38729 150 aa0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q FLX1P40464 311 aa0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q DOC1P53068 250 aa0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSH5Q12175 901 aa0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRP8P33334 2413 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRX1P22217 103 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YET1P35723 206 aa0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRY1P36007 326 aa0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEX17P40155 199 aa0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q COA1P40452 197 aa0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCD14P46959 383 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
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