RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A SNA3P14359 133 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A FIS1P40515 155 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A TIR3P40552 269 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A DSN1P40568 576 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A RPL33BP41056 107 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MRH4P53166 561 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A GOT1Q03554 138 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A ATG39Q06159 398 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A TPO4Q12256 659 aa0.21□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MRX3P38172 270 aa0.2□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A RIO2P40160 425 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A SNZ3P43545 298 aa0.2□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A RMR1P53060 241 aa0.2□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A ERV41Q04651 352 aa0.2□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A SNF8Q12483 233 aa0.2□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MSB2P32334 1306 aa0.19□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A FZF1P32805 299 aa0.19□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MRX5P47007 382 aa0.19□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YJR012CP47087 207 aa0.19□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A SSA3P09435 649 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MET16P18408 261 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MEI4P29467 408 aa0.18□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A QRI5P32344 111 aa0.18□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A BOL2P53082 120 aa0.18□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YPL257WQ08974 193 aa0.18□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A EHD3P28817 500 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YPT52P36018 234 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A BIG1P38813 335 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A COA1P40452 197 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YJR056CP47115 236 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A ATG17Q06410 417 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A ANT1Q06497 328 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YPR172WQ06608 200 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A REX3Q12090 404 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YCT1Q12235 531 aa0.17□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A RSR1P13856 272 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A PBN1P25580 416 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A THO1P40040 218 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YNL217WP40152 326 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MPP6P53725 186 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MSA1Q08471 629 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A MDY2Q12285 212 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A FMP16Q12497 93 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa0.16□□□□□ -2.38
YMR001C-AYMR001C-A YKR104WP0CE69 306 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A TPM1P17536 199 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A VPS3P23643 1011 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A TVP38P36164 337 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RRF1P38771 230 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A GAA1P39012 614 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A DDI1P40087 428 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A SOK1P40317 901 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A OST6Q03723 332 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A COQ10Q08058 207 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YOR186WQ08560 144 aa0.15□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YKL070WP36087 169 aa0.14□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YAR068WP39564 161 aa0.14□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A GPI8P49018 411 aa0.14□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A HIS1P00498 297 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A JEN1P36035 616 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RPF1P38805 295 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A PGD1P40356 397 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RSM25P40496 264 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A SAY1P53324 424 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A SNZ2P53824 298 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RRP40Q08285 240 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YDL180WQ12301 547 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A HTL1Q9URQ5 78 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A MET5P47169 1442 aa0.13□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A IPP1P00817 287 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A BLI1P35727 113 aa0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A MRPL39P36533 70 aa0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A ECM33P38248 429 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YRB2P40517 327 aa0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RPA43P46669 326 aa0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A CUS2P53830 285 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A GMC2Q06201 188 aa0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A NIP7Q08962 181 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A CDC8P00572 216 aa0.11□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A RNA15P25299 296 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A SPG4Q04438 115 aa0.11□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YOR020W-AQ3E824 90 aa0.11□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A FCY2P17064 533 aa0.1□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A YBR096WP38256 230 aa0.1□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A MEP1P40260 492 aa0.1□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A HAM1P47119 197 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
YMR001C-AYMR001C-A TFC1P32367 649 aa0.09□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A SRY1P36007 326 aa0.09□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A VPS21P36017 210 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A GOS1P38736 223 aa0.09□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A SMB1P40018 196 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A STF1P01098 86 aa0.08□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YHR212W-AP0CX91 67 aa0.08□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A AIF1P52923 378 aa0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 110.2 ms