RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	YNL260C	P53846	198 aa		0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	ERV41	Q04651	352 aa		0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	COQ10	Q08058	207 aa		0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	MSH5	Q12175	901 aa		0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YHR139C-A	O13536	103 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SNA3	P14359	133 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	FZF1	P32805	299 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YBR096W	P38256	230 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	TIR3	P40552	269 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RPA43	P46669	326 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	BOL2	P53082	120 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YDR124W	Q04608	324 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	ATG39	Q06159	398 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	MSA1	Q08471	629 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	REX3	Q12090	404 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	PBN1	P25580	416 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	MEI4	P29467	408 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	JEN1	P36035	616 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	GAA1	P39012	614 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	COA1	P40452	197 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	FIS1	P40515	155 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YJR012C	P47087	207 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YNL046W	P53956	172 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SPP2	Q02521	185 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YPL257W	Q08974	193 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	TPO4	Q12256	659 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SNF8	Q12483	233 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	FMP16	Q12497	93 aa		0	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YKR104W	P0CE69	306 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SRY1	P36007	326 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	FZO1	P38297	855 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	GOS1	P38736	223 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YNL217W	P40152	326 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SNZ2	P53824	298 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	GOT1	Q03554	138 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	OST6	Q03723	332 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YPL162C	Q12042	273 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YCT1	Q12235	531 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SPT7	P35177	1332 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	PDR18	P53756	1333 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	VPS3	P23643	1011 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YKL070W	P36087	169 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	DDI1	P40087	428 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YFL065C	P43539	102 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	RMR1	P53060	241 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YNR077C	P53758	84 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YMR007W	Q03675	126 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	TRM12	Q04235	462 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	ANT1	Q06497	328 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	MDY2	Q12285	212 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	CDC8	P00572	216 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	FCY2	P17064	533 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SOK1	P40317	901 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	MRX5	P47007	382 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	GLG2	P47011	380 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	YJR056C	P47115	236 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	DOC1	P53068	250 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	SPG4	Q04438	115 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	GMC2	Q06201	188 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	ATG17	Q06410	417 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	PSF1	Q12488	208 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
BLI1	YKL061W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	ERD2	P18414	219 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	BLI1	P35727	113 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	YBR063C	P38083	404 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	RRF1	P38771	230 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	YAR068W	P39564	161 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
BLI1	YKL061W	PGD1	P40356	397 aa		-0.04	□□□□□ -2.42

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