RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W YPK3P38070 525 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SLM4P38247 162 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W IPT1P38954 527 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YER188WP40103 239 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YRB2P40517 327 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YHC3P47040 408 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SMM1P53720 384 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W BUD17P53727 317 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W ASI3P53983 676 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W HHT1P61830 136 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YDC1Q02896 317 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SNZ1Q03148 297 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W PRM15Q03262 622 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MSS11Q03825 758 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W CSI2Q08054 341 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YPL119C-AQ3E751 87 aa4.55□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W MES1P00958 751 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W GPP2P40106 250 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TIR3P40552 269 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W CCC1P47818 322 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TAF4P50105 388 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W VOA1P53262 265 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SAY1P53324 424 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FRE3Q08905 711 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TGS1Q12052 315 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W USB1Q12208 290 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YLR108CQ12259 485 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data4.54□□□□□ -1.68 RIP-Chip
TIM54YJL054W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W VCX1Q99385 411 aa4.54□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RPL39P04650 51 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W FAR1P21268 830 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SSE2P32590 693 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W REC114P32841 428 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W VMA11P32842 164 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W CTR2P38865 189 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W CTK2P46962 323 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YJL016WP47072 561 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W GEP7P53171 287 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YGR151CP53287 111 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SAM50P53969 484 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W RIM9Q04734 239 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YPR098CQ06089 161 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YLR345WQ06137 509 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TPO3Q06451 622 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W SSK1Q07084 712 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W YDL086WQ07505 273 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W ISA2Q12425 185 aa4.53□□□□□ -1.68
TIM54YJL054W TDH2P00358 332 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YGL041W-AP0C5N3 154 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W RPL30P14120 105 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YOX1P34161 385 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YKR015CP36111 568 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W ARC40P38328 384 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YHR035WP38769 630 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W MDM31P38880 579 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YNR048WP53740 393 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YNR064CP53750 290 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W DUG3P53871 357 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W FIN1Q03898 291 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W ARP10Q04549 284 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W GAL83Q04739 417 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YOR378WQ08902 515 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W TAF3Q12297 353 aa4.52□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W KIN28P06242 306 aa4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W AIM10P39965 576 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W CIN2P46670 268 aa4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W VMA10P48836 114 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W NRK1P53915 240 aa4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YMR317WQ04893 1140 aa4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W MSA1Q08471 629 aa4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W THP3Q12049 470 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W IDP1P21954 428 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W HXT2P23585 541 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W PRE4P30657 266 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W NDC1P32500 655 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W SHE1P38200 338 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W GPI18P38211 433 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W TCM62P38228 572 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YBR285WP38354 144 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YLF2P38746 405 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W SLM1P40485 686 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W ILM1P47155 203 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W SLD3P53135 668 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W AAH1P53909 347 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W YMR087WQ04299 284 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data4.5□□□□□ -1.69not detected
TIM54YJL054W RFU1Q08003 200 aa4.5□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W SAG1P20840 650 aa4.49□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W IES6P32617 166 aa4.49□□□□□ -1.69
TIM54YJL054W SDS22P36047 338 aa4.49□□□□□ -1.69
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