RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A VPS20Q04272 221 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A DPP1Q05521 289 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YFH1Q07540 174 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A YOR292CQ08743 309 aa-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
YPL060C-AYPL060C-A THR4P16120 514 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A BUD2P33314 1104 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SUR2P38992 349 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A BUD25P85052 153 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RIO1Q12196 484 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A DCN1Q12395 269 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TDH2P00358 332 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A UTP25P40498 721 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CUE3P53137 624 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YDL121CQ07541 149 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YBL008W-AQ3E821 79 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MSB2P32334 1306 aa-0.29□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A STF1P01098 86 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YHR032W-AP0C5N6 59 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YGL010WP25338 174 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CHA1P25379 360 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A PSO2P30620 661 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MRPL39P36533 70 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ASC1P38011 319 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SER3P40054 469 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A AVT7P40501 490 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SYS1P41544 203 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YNR066CP53752 436 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YMD8Q03697 442 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A GPN3Q06543 272 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CTR3Q06686 241 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SPE3Q12074 293 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YDR018CQ12185 396 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RPL26AP05743 127 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SMI1P32566 505 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A DSN1P40568 576 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A PMT4P46971 762 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RPL26BP53221 127 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ASI3P53983 676 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SEC13Q04491 297 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A BOP2Q06150 570 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.3□□□□□ -2.46not detected
YPL060C-AYPL060C-A MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YAL063C-AQ3E791 96 aa-0.3□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MSW1P04803 379 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TAF6P53040 516 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TAF9Q05027 157 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ASR1Q06834 288 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MCT1Q12283 360 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YOL085CQ99345 113 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A VMA2P16140 517 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YHR022CP38763 256 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TVP23P38962 199 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YIL102CP40488 101 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SRB7P47822 140 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ECM18Q04623 453 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A HIS3P06633 220 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YSR3P23501 404 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MXR2P25566 168 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RPB9P27999 122 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.31□□□□□ -2.46not detected
YPL060C-AYPL060C-A VMA8P32610 256 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SKG1P36169 355 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A BTT1P40314 149 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A FIS1P40515 155 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A COS6P53344 381 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SCS7Q03529 384 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ECM19Q06011 112 aa-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RPN5Q12250 445 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A PEX4P29340 183 aa-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A GCG1P32656 232 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CPD1P53314 239 aa-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ARO3P14843 370 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YHR035WP38769 630 aa-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A IES5P40060 125 aa-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SEC28P40509 296 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A TAF10Q12030 206 aa-0.32□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A STE3P06783 470 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A GAL7P08431 366 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A VPH1P32563 840 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YHR177WP38867 453 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A GDS1P41913 522 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RHO3Q00245 231 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SEC16P48415 2195 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A CDC42P19073 191 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A YCR102CP25608 368 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A RDS1P25611 832 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ERG9P29704 444 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MNN9P39107 395 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data-0.33□□□□□ -2.46not detected
YPL060C-AYPL060C-A SUR7P54003 302 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A MSF1P08425 469 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A FCY2P17064 533 aa-0.33□□□□□ -2.46
YPL060C-AYPL060C-A SPT4P32914 102 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
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