RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	YJL043W	P47053	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	COX18	P53239	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	GRX5	Q02784	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MCM21	Q06675	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NDE2	Q07500	545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	IES3	Q12345	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ERS1	P17261	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YMR31	P19955	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NUP2	P32499	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YHR078W	P38799	552 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YDL186W	P48568	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PEX10	Q05568	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	BUR2	Q05949	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	FRE5	Q08908	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	VPS68	Q12016	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MED11	Q99278	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PET20	Q99373	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	HIS5	P07172	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CLB2	P24869	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ITR2	P30606	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
VMA13	YPR036W	SPT10	P35208	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MET30	P39014	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	VRG4	P40107	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	APQ12	P40532	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PAC11	P40960	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SWP82	P43554	623 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PRM8	P53174	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MSC1	Q03104	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	COQ11	Q05892	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	COX3	P00420	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SIR3	P06701	978 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	QDR3	P38227	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	DER1	P38307	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YHR177W	P38867	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CTF8	P38877	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	IPT1	P38954	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SEN34	P39707	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SPO73	P40031	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	BAP3	P41815	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	BIR1	P47134	954 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SPT20	P50875	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SNO2	P53823	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ASI1	P54074	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	HOF1	Q05080	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TEN1	Q07921	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SIA1	Q12212	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CTS1	P29029	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	COQ2	P32378	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RPC34	P32910	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	MCH2	P36032	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RRN10	P38204	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	UIP3	P39547	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	AIM2	P39721	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TED1	P40533	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PRM10	P42946	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SBH2	P52871	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	GPI17	Q04080	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YML053C	Q04978	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	DXO1	Q06349	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ARR3	Q06598	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	CYK3	Q07533	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PLB3	Q08108	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	PFA4	Q12006	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TRM10	Q12400	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	STT4	P37297	1900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	AAC1	P04710	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RIP1	P08067	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	ELO2	P25358	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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