RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	ASM4	Q05166	528 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	GPN3	Q06543	272 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	AIM6	Q07716	390 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MDM32	Q12171	622 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	FRE7	Q12333	620 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
TRM10	YOL093W	RRI1	Q12468	440 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	QCR7	P00128	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	NAM2	P11325	894 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	HMG1	P12683	1054 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	GIT1	P25346	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	ITR1	P30605	584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
TRM10	YOL093W	SPT10	P35208	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
TRM10	YOL093W	GPX2	P38143	162 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	FCY21	P40039	528 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SHO1	P40073	367 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MNN5	P46982	586 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	IKS1	P47042	667 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PGU1	P47180	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YGR066C	P53242	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YGR126W	P53274	230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SDC1	Q03323	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MRX8	Q05473	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	HRT1	Q08273	121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	BTS1	Q12051	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YPR1	Q12458	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	FRE6	Q12473	712 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	CDC9	P04819	755 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	STE12	P13574	688 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	FUN26	P31381	517 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	ARO7	P32178	256 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	THI4	P32318	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PAU24	P38155	120 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YBR096W	P38256	230 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MBA1	P38300	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	OM14	P38325	134 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PCL6	P40038	420 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SLZ1	P40167	298 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	GDS1	P41913	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	QRI7	P43122	407 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YFR054C	P43622	192 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RPE1	P46969	238 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	BRR6	P53062	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SUR7	P54003	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	ATG21	Q02887	496 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	BNA7	Q04066	261 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MED2	Q12124	431 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SIR2	P06700	562 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	COX9	P07255	59 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RPB8	P20436	146 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	SCO1	P23833	295 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	DOA4	P32571	926 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RPC34	P32910	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	THI2	P38141	450 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	AIM20	P40451	204 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	NAS2	P40555	220 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PMT6	P42934	759 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	YJL055W	P47044	245 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	CCC1	P47818	322 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	PMT5	P52867	743 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	MTM1	P53320	366 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	CPR8	P53728	308 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TRM10	YOL093W	BSC5	P53755	489 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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