RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	GPX2	P38143	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	SDS24	P38314	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YHI9	P38765	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	SSN2	P38931	1420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	GAT1	P43574	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	PDR17	P53844	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	DYN3	Q04949	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	HMS1	Q12398	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	CPR3	P25719	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	MGT1	P26188	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
HOF1	YMR032W	KRE29	P40026	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	ECL1	P48235	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	FRE4	P53746	719 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YML108W	Q03759	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	NCA2	Q12374	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	RIB3	Q99258	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	NMT1	P14743	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	GLN3	P18494	730 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	SPO11	P23179	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	SPC34	P36131	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	NDT80	P38830	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	RMD6	P39975	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YIP1	P53039	248 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	RHO4	Q00246	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	RIM2	P38127	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ERV46	P39727	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	UBC13	P52490	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	CSN9	Q03981	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	LTE1	P07866	1435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MAK32	P23060	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ARO7	P32178	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SRY1	P36007	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SLM6	P38343	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	LAG1	P38703	411 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YHK8	P38776	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RRG9	P40156	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	PHO23	P50947	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SWC4	P53201	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MDS3	P53094	1487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	DNF1	P32660	1571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TAF2	P23255	1407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	EPT1	P22140	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	LSB5	P25369	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TRX3	P25372	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	KAR9	P32526	644 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MRPL3	P36516	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	GEP4	P38812	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	EXO1	P39875	702 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ARG2	P40360	574 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YPS5	P53057	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TOS8	P53147	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SWP1	Q02795	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MRX4	Q12467	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YBR137W	P38276	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	IKS1	P47042	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	VHT1	P53241	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	SWS2	P53937	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	ARL3	Q02804	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	COQ10	Q08058	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	BUD4	P47136	1447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	REP1	P03871	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MRS1	P07266	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	MET2	P08465	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YEF1	P32622	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YCR041W	P37265	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	UBP5	P39944	805 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HOF1	YMR032W	YIL029C	P40538	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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