RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C YNL050CP53952 270 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YLR297WQ05899 129 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YLR446WQ06204 433 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MRX4Q12467 430 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C BCK1Q01389 1478 aa1.86□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C TDH2P00358 332 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C CDC8P00572 216 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YAK1P14680 807 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MSS116P15424 664 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C OPI1P21957 404 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C TRX1P22217 103 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C IFM1P25038 676 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SRB4P32569 687 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C CDC13P32797 924 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C NUF2P33895 451 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data1.85□□□□□ -2.11not detected
CSE4YKL049C YBR062CP38239 180 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SSO2P39926 295 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SWC4P53201 476 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C MAL13P53338 473 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPL278CQ08990 100 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPR1Q12458 312 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YAL063C-AQ3E791 96 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C DDP1Q99321 188 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C IZH4Q99393 312 aa1.85□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YOL163WP0CF20 169 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C KRE1P17260 313 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PET18P25362 215 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C RPC19P28000 142 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C TPO5P36029 618 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YKR032WP36127 104 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YPC1P38298 316 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C FET3P38993 636 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C SCC4P40090 624 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YIL012WP40551 113 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YFL064CP43540 174 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PRP24P49960 444 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C LIF1P53150 421 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C ERV41Q04651 352 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C APC9Q12107 265 aa1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
CSE4YKL049C YRF1-1P0CX20 1796 aa1.84□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YRF1-5P0CX21 1796 aa1.84□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YRF1-8P0CX22 1796 aa1.84□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C URB1P34241 1764 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C VPS1P21576 704 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C GCG1P32656 232 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C UBC6P33296 250 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MRPL3P36516 390 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YHL044WP38727 235 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YIL001WP40560 513 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YJR079WP47126 109 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C UBC13P52490 153 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C OSH6Q02201 448 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MIX17Q03667 156 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ARO80Q04052 950 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MGR3Q04472 501 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C VAC14Q06708 880 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C FEX1Q08913 375 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C FEX2Q08991 375 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YPL150WQ12152 901 aa1.83□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C CAR2P07991 424 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C MATALPHA2P0CY08 210 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C HMLALPHA2P0CY09 210 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C CDC10P25342 322 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YCR025CP25352 136 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RSA4P25382 515 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C IMP1P28627 190 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RPC37P36121 282 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C FZO1P38297 855 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C TDA11P38854 504 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C VAB2P40003 282 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YER084WP40057 128 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C GVP36P40531 326 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SYS1P41544 203 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RIB4P50861 169 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C HOP2P53187 214 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C DBP6P53734 629 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C FAR8Q05040 523 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C SFH1Q06168 426 aa1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C APC1P53886 1748 aa1.81□□□□□ -2.12
CSE4YKL049C RAD7P06779 565 aa1.81□□□□□ -2.12
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