RNA–Protein interactions for RNA: YHR129C

ARP1, Transcript of Actin-related protein of the dynactin complex, yeast

Gene ARP1, Length 1,155 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP1	YHR129C	PHO80	P20052	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	EPT1	P22140	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TFC1	P32367	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TOD6	P34219	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	THI80	P35202	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YKL075C	P36083	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	NDT80	P38830	627 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TDA10	P42938	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TRM9	P49957	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	PDR17	P53844	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	UBC7	Q02159	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	CWC27	Q02770	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YMR166C	Q03829	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	SWF1	Q04629	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	LDB18	Q07887	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	TAF10	Q12030	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARP1	YHR129C	SUC2	P00724	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ALG7	P07286	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TFS1	P14306	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ERD1	P16151	362 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	CLB2	P24869	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YCR023C	P25351	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	INO2	P26798	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	OCH1	P31755	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	UTR4	P32626	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TVP38	P36164	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRPL28	P36527	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SDS24	P38314	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	GAT1	P43574	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	COG7	P53195	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	CDH1	P53197	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	NMA2	P53204	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SWP1	Q02795	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TRS23	Q03784	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SDH7	Q04401	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ROT2	P38138	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YBR096W	P38256	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	POP4	P38336	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	KRE29	P40026	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	FAU1	P40099	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MAM33	P40513	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	AZF1	P41696	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PCP1	P53259	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	DID2	P69771	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	BNA5	Q05979	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	RTR2	Q12378	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PEX11	Q12462	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	STH1	P32597	1359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	BAR1	P12630	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	FCY2	P17064	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	TRX3	P25372	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ARO7	P32178	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	YBL010C	P32788	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	MRPL3	P36516	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	FRM2	P37261	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	SLM6	P38343	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	NVJ1	P38881	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	CPR7	P47103	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	AIM39	Q08223	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	ERV2	Q12284	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARP1	YHR129C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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