RNA–Protein interactions for RNA: YGR063C

SPT4, Transcript of Component of the universally conserved Spt4/5 complex (DSIF complex), yeastyeast

Gene SPT4, Length 309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT4YGR063C TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C QDR3P38227 689 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YHR122WP38829 231 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C GDI1P39958 451 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YIL152WP40455 235 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C EMC5P40540 141 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C FKH2P41813 862 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YAR1P46683 200 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TAM41P53230 385 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C BUD17P53727 317 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C ASI3P53983 676 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C CDC14Q00684 551 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C RSM23Q01163 450 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YPL080CQ02826 108 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TY2A-DR2Q03483 438 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C BNA5Q05979 453 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C ATG39Q06159 398 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C KEI1Q06346 221 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C IPK1Q06667 281 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C CTR3Q06686 241 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C SWC7Q06707 132 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C GPB1Q08886 897 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YOR385WQ08909 290 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C SRL2Q12020 392 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YPR027CQ12079 277 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C NBP2Q12163 236 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C VAM3Q12241 283 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TY2A-BQ12260 438 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TY2A-OR2Q12293 438 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TY2A-DR1Q12392 438 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TY2A-OR1Q12439 438 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C WIP1Q2V2P8 89 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C SLO1Q3E784 85 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C TY2A-DR3Q99303 438 aa3.22□□□□□ -1.89
SPT4YGR063C YLR358CO13565 187 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C COX2P00410 251 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C HIS1P00498 297 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C AI3P03877 415 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SWI5P08153 709 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TIR1P10863 254 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SNF5P18480 905 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RPB5P20434 215 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SCL1P21243 252 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PRE8P23639 250 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C GRX1P25373 110 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ADH7P25377 361 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C AFG1P32317 509 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SSH4P32343 579 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C UTR2P32623 467 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C ADD66P36040 267 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MRPS9P38120 278 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BNA4P38169 460 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YBR197CP38306 217 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CUE1P38428 203 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MGE1P38523 228 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YHL044WP38727 235 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C FMO1P38866 432 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C GPI16P38875 610 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CHL4P38907 458 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PAC2P39937 518 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C HAT2P39984 401 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SPC25P40014 221 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RRD1P40454 393 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C FIS1P40515 155 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PFD1P46988 109 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C STE24P47154 453 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YGR079WP53249 370 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C RHO4Q00246 291 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MET14Q02196 202 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C SPP2Q02521 185 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C HED1Q03937 162 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C DUS4Q06063 367 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BLS1Q06071 122 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CNL1Q06333 122 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TDA6Q06466 467 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BER1Q06688 274 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C AAD4Q07747 329 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PLB3Q08108 686 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PER33Q12144 273 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.21□□□□□ -1.9not detected
SPT4YGR063C PST1Q12355 444 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C FRE6Q12473 712 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C COX19Q3E731 98 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YLR099W-AQ3E798 87 aa3.21□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C YOR304C-AO14468 76 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C CYC7P00045 113 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.2□□□□□ -1.9not detected
SPT4YGR063C GAC1P28006 793 aa3.2□□□□□ -1.9
SPT4YGR063C PRE4P30657 266 aa3.2□□□□□ -1.9
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