RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	SHC1	P39000	512 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YNL194C	P40169	301 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	SLM1	P40485	686 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	IBA57	P47158	497 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	VEL1	P53058	206 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YGL159W	P53110	370 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	SNX41	Q04053	625 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	PEX10	Q05568	337 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	PLB3	Q08108	686 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
NEM1	YHR004C	QCR2	P07257	368 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TFS1	P14306	219 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	DRE2	P36152	348 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CHK1	P38147	527 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TOS2	P50078	622 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MST27	P53176	234 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SPC2	Q04969	178 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	JLP1	Q12358	412 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CAP2	P13517	287 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MCH2	P36032	473 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RIB5	P38145	238 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MST28	P39552	234 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	POG1	P40473	351 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YCH1	P42937	148 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MIC26	P50087	233 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	USE1	P53146	245 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	IGO1	P53897	168 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PEX12	Q04370	399 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PRM6	Q04705	352 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	BCH1	Q05029	724 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SFH1	Q06168	426 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	IRC25	Q07951	179 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YCT1	Q12235	531 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TFC7	Q12415	435 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	QCR7	P00128	127 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	NAM2	P11325	894 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ERD1	P16151	362 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CAF4	P36130	643 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	DTR1	P38125	572 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	AME1	P38313	324 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SHG1	P38337	142 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SRP14	P38985	146 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	VAB2	P40003	282 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MAM33	P40513	266 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YJL016W	P47072	561 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YJR149W	P47177	404 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YNL095C	P53932	642 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ASI3	P53983	676 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	HEM25	Q07534	307 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	GAT3	Q07928	141 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	DDC1	Q08949	612 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SNA3	P14359	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	IFM1	P25038	676 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	INO2	P26798	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TAF14	P35189	244 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	FIG1	P38224	298 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	COX14	P39103	70 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PMT4	P46971	762 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	IRC18	P47056	224 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YJR079W	P47126	109 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MIG2	P53035	382 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	FYV6	P53913	173 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MTQ1	P53944	314 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CTF19	Q02732	369 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	VHS1	Q03785	461 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	NNT1	Q05874	261 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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