Protein–RNA interactions for Protein: Q04370

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX12Q04370 NSR1YGR159C 1245 nt19.28■□□□□ 0.68
PEX12Q04370 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.02■□□□□ 0.64
PEX12Q04370 NOP1YDL014W 984 nt18.35■□□□□ 0.53
PEX12Q04370 MDJ1YFL016C 1536 nt17.47■□□□□ 0.39
PEX12Q04370 YKL036CYKL036C 393 nt16.53■□□□□ 0.24
PEX12Q04370 YJL027CYJL027C 417 nt16.11■□□□□ 0.17
PEX12Q04370 SRX1YKL086W 384 nt16.02■□□□□ 0.16
PEX12Q04370 Q0297Q0297 156 nt15.92■□□□□ 0.14
PEX12Q04370 DBP2YNL112W 1641 nt15.31■□□□□ 0.04
PEX12Q04370 YCR051WYCR051W 669 nt15.16■□□□□ 0.02
PEX12Q04370 YBR190WYBR190W 312 nt15.04■□□□□ -0
PEX12Q04370 SCS3YGL126W 1143 nt14.82□□□□□ -0.04
PEX12Q04370 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.73□□□□□ -0.05
PEX12Q04370 RTC3YHR087W 336 nt14.67□□□□□ -0.06
PEX12Q04370 CCC1YLR220W 969 nt14.56□□□□□ -0.08
PEX12Q04370 RVS167YDR388W 1449 nt14.32□□□□□ -0.12
PEX12Q04370 YOL085CYOL085C 342 nt14.32□□□□□ -0.12
PEX12Q04370 RPP1BYDL130W 321 nt14.28□□□□□ -0.12
PEX12Q04370 PKP1YIL042C 1185 nt14.14□□□□□ -0.15
PEX12Q04370 SCJ1YMR214W 1134 nt14.13□□□□□ -0.15
PEX12Q04370 SSA3YBL075C 1950 nt14.03□□□□□ -0.16
PEX12Q04370 PUT4YOR348C 1884 nt13.96□□□□□ -0.17
PEX12Q04370 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.79□□□□□ -0.2
PEX12Q04370 SHR5YOL110W 714 nt13.72□□□□□ -0.21
PEX12Q04370 PET122YER153C 765 nt13.67□□□□□ -0.22
PEX12Q04370 URN1YPR152C 1398 nt13.58□□□□□ -0.23
PEX12Q04370 ARE1YCR048W 1833 nt13.58□□□□□ -0.24
PEX12Q04370 SAH1YER043C 1350 nt13.48□□□□□ -0.25
PEX12Q04370 OPI9YLR338W 858 nt13.48□□□□□ -0.25
PEX12Q04370 POA1YBR022W 534 nt13.48□□□□□ -0.25
PEX12Q04370 DEP1YAL013W 1218 nt13.44□□□□□ -0.26
PEX12Q04370 SCR1SCR1 522 nt13.44□□□□□ -0.26
PEX12Q04370 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.4□□□□□ -0.26
PEX12Q04370 YDJ1YNL064C 1230 nt13.36□□□□□ -0.27
PEX12Q04370 RPN10YHR200W 807 nt13.31□□□□□ -0.28
PEX12Q04370 BSC6YOL137W 1494 nt13.27□□□□□ -0.29
PEX12Q04370 RRN5YLR141W 1092 nt13.24□□□□□ -0.29
PEX12Q04370 YNL208WYNL208W 600 nt13.21□□□□□ -0.29
PEX12Q04370 ATS1YAL020C 1002 nt13.15□□□□□ -0.3
PEX12Q04370 GAR1YHR089C 618 nt13.11□□□□□ -0.31
PEX12Q04370 PUN1YLR414C 792 nt13.09□□□□□ -0.31
PEX12Q04370 BUD23YCR047C 828 nt13.06□□□□□ -0.32
PEX12Q04370 PTC2YER089C 1395 nt12.99□□□□□ -0.33
PEX12Q04370 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.98□□□□□ -0.33
PEX12Q04370 SPT5YML010W 3192 nt12.98□□□□□ -0.33
PEX12Q04370 YJR018WYJR018W 363 nt12.94□□□□□ -0.34
PEX12Q04370 NAB2YGL122C 1578 nt12.89□□□□□ -0.35
PEX12Q04370 RSB1YOR049C 1065 nt12.85□□□□□ -0.35
PEX12Q04370 TIR1YER011W 765 nt12.7□□□□□ -0.38
PEX12Q04370 SSA4YER103W 1929 nt12.69□□□□□ -0.38
PEX12Q04370 FIS1YIL065C 468 nt12.65□□□□□ -0.38
PEX12Q04370 DAL1YIR027C 1383 nt12.64□□□□□ -0.39
PEX12Q04370 SSA1YAL005C 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
PEX12Q04370 YJR120WYJR120W 351 nt12.62□□□□□ -0.39
PEX12Q04370 RPP2BYDR382W 333 nt12.58□□□□□ -0.4
PEX12Q04370 FPR4YLR449W 1179 nt12.58□□□□□ -0.4
PEX12Q04370 INM2YDR287W 879 nt12.54□□□□□ -0.4
PEX12Q04370 PHO4YFR034C 939 nt12.51□□□□□ -0.41
PEX12Q04370 MEP2YNL142W 1500 nt12.51□□□□□ -0.41
PEX12Q04370 YPS1YLR120C 1710 nt12.42□□□□□ -0.42
PEX12Q04370 YBL100CYBL100C 315 nt12.34□□□□□ -0.43
PEX12Q04370 SRB2YHR041C 633 nt12.3□□□□□ -0.44
PEX12Q04370 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.3□□□□□ -0.44
PEX12Q04370 DCW1YKL046C 1350 nt12.29□□□□□ -0.44
PEX12Q04370 YDR095CYDR095C 411 nt12.27□□□□□ -0.45
PEX12Q04370 BDF1YLR399C 2061 nt12.25□□□□□ -0.45
PEX12Q04370 PST2YDR032C 597 nt12.25□□□□□ -0.45
PEX12Q04370 BDH2YAL061W 1254 nt12.25□□□□□ -0.45
PEX12Q04370 FUN26YAL022C 1554 nt12.18□□□□□ -0.46
PEX12Q04370 EMI2YDR516C 1503 nt12.13□□□□□ -0.47
PEX12Q04370 YMR090WYMR090W 684 nt12.1□□□□□ -0.47
PEX12Q04370 ALF1YNL148C 765 nt12.1□□□□□ -0.47
PEX12Q04370 TRM9YML014W 840 nt12.09□□□□□ -0.47
PEX12Q04370 TAT1YBR069C 1860 nt12.08□□□□□ -0.48
PEX12Q04370 WWM1YFL010C 636 nt12.05□□□□□ -0.48
PEX12Q04370 RPP2AYOL039W 321 nt12.05□□□□□ -0.48
PEX12Q04370 YBR220CYBR220C 1683 nt12.03□□□□□ -0.48
PEX12Q04370 LSM3YLR438C-A 270 nt12.03□□□□□ -0.48
PEX12Q04370 PTP1YDL230W 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
PEX12Q04370 YDL221WYDL221W 552 nt12.01□□□□□ -0.49
PEX12Q04370 CAC2YML102W 1407 nt12□□□□□ -0.49
PEX12Q04370 CCT6YDR188W 1641 nt12□□□□□ -0.49
PEX12Q04370 SDH1YKL148C 1923 nt11.95□□□□□ -0.5
PEX12Q04370 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PEX12Q04370 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PEX12Q04370 SIS1YNL007C 1059 nt11.93□□□□□ -0.5
PEX12Q04370 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.89□□□□□ -0.51
PEX12Q04370 YGR021WYGR021W 873 nt11.89□□□□□ -0.51
PEX12Q04370 SHU1YHL006C 453 nt11.84□□□□□ -0.51
PEX12Q04370 IRC15YPL017C 1500 nt11.82□□□□□ -0.52
PEX12Q04370 SCC4YER147C 1875 nt11.82□□□□□ -0.52
PEX12Q04370 HOM6YJR139C 1080 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.6 ms