RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	SLT2	Q00772	484 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YDR209C	Q03480	137 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	BNA7	Q04066	261 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	FAR10	Q06001	478 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CTR3	Q06686	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	RSA1	Q08932	381 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	ERV2	Q12284	196 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MHP1	P43638	1398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	JIP3	O13555	125 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	COQ1	P18900	473 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	IFM1	P25038	676 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	GIT1	P25346	518 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PBN1	P25580	416 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	YBL059W	P34224	193 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CAB3	P36076	571 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	MRX3	P38172	270 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SDS24	P38314	527 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PFS1	P38872	237 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	ASG7	P46993	209 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	BIR1	P47134	954 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	BNS1	P50084	137 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CDH1	P53197	566 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	CRH1	P53301	507 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	SFH1	Q06168	426 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	IRC25	Q07951	179 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	PER33	Q12144	273 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	IZH2	Q12442	317 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CMR3	YPR013C	QCR6	P00127	147 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	ZRC1	P20107	442 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	MAL32	P38158	584 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	CHL4	P38907	458 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YAT2	P40017	923 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	PAN6	P40459	309 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	ATG18	P43601	500 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	MAL12	P53341	584 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	VAC7	P53950	1165 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	CDC14	Q00684	551 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	GMC1	Q04399	608 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SPO77	Q06134	477 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	CSM4	Q08955	156 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	PLP2	Q12017	286 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	MCT1	Q12283	360 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SNF8	Q12483	233 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RCK1	P38622	512 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	PET8	P38921	284 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SHC1	P39000	512 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	HEM14	P40012	539 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	REE1	P40893	198 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YJR012C	P47087	207 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	PEX31	P53203	462 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	PEX30	Q06169	523 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	LAG2	Q92325	660 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YER186C	P40101	306 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	TPC1	P53257	314 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	TAF9	Q05027	157 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	DPP1	Q05521	289 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	STE7	P06784	515 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RPO26	P20435	155 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	DAL81	P21657	970 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RPC17	P47076	161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	HOC1	P47124	396 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	IBA57	P47158	497 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	TPN1	P53099	579 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	MAL13	P53338	473 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	SCS7	Q03529	384 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	FDH1	Q08911	376 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	NCB2	Q92317	146 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	YKL187C	P34231	750 aa		3.67	□□□□□ -1.82
CMR3	YPR013C	OXA1	P39952	402 aa		3.67	□□□□□ -1.82

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