RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
YKR047WYKR047W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
YKR047WYKR047W SHE1P38200 338 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W OM14P38325 134 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W GAB1P41733 394 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W STB1P42845 420 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W TIM21P53220 239 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YDR115WQ04598 105 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W TLG2Q08144 397 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YOR376WQ08900 122 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YOR029WQ12243 111 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W HRT3Q12347 344 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W LAG2Q92325 660 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W BI3Q9ZZW7 517 aa3.82□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W PRB1P09232 635 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MRPL6P32904 214 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W CSE1P33307 960 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MSN4P33749 630 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W BMT2P38278 337 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W TCD1P38756 429 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SNM1P40993 198 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W IGD1P43598 195 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W TAD2P47058 250 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W ATG31Q12421 196 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YBL111CQ3E7Y5 667 aa3.81□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W BGL2P15703 313 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W HIT1P46973 164 aa3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YPT32P51996 222 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W PEX30Q06169 523 aa3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MMT2Q08970 484 aa3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W IFM1P25038 676 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W POF1P25576 258 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SUA5P32579 426 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W BMH2P34730 273 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SDS24P38314 527 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YER085CP40058 173 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W DDI1P40087 428 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W GCN20P43535 752 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MNT4P53745 580 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MRX11Q03079 207 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W ADD37Q03233 198 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W DPP1Q05521 289 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W PAM18Q07914 168 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MIM1Q08176 113 aa3.79□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YBR062CP38239 180 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W DED81P38707 554 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SDS23P53172 527 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W PEX31P53203 462 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W MRPL50P53724 139 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YNR066CP53752 436 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W CDC14Q00684 551 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SFH1Q06168 426 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W CTR3Q06686 241 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W SRO7Q12038 1033 aa3.78□□□□□ -1.8
YKR047WYKR047W KRE6P32486 720 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W SRB4P32569 687 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W IES6P32617 166 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W CYM1P32898 989 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W NPT1P39683 429 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W RMI1Q02685 241 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W TAF9Q05027 157 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W VIK1Q12045 647 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W PER33Q12144 273 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W MSH5Q12175 901 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W YOR114WQ12219 294 aa3.77□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W ZIP1P31111 875 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W DOA4P32571 926 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W YKL187CP34231 750 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W EFM1P38732 585 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W VAB2P40003 282 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W KTR6P54070 446 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W INP2Q03824 705 aa3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W RPS3P05750 240 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W ASP3-2P0CX77 362 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W ASP3-3P0CX78 362 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W ASP3-4P0CX79 362 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W ASP3-1P0CZ17 362 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W GPX1P36014 167 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W YKT6P36015 200 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W GPI18P38211 433 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W PRS2P38620 318 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W GGC1P38988 300 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W RPL10P41805 221 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W ASG7P46993 209 aa3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
YKR047WYKR047W TPN1P53099 579 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.4 ms