RNA–Protein interactions for RNA: YHR019C

DED81, Transcript of Cytosolic asparaginyl-tRNA synthetase, yeast

Gene DED81, Length 1,665 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DED81	YHR019C	HRT1	Q08273	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	BTS1	Q12051	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MCP1	Q12106	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RLM1	Q12224	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YPR1	Q12458	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	HOM3	P10869	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CAP2	P13517	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RPB8	P20436	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	BOS1	P25385	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
DED81	YHR019C	CHK1	P38147	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	ALG3	P38179	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PHO90	P39535	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YIL067C	P40514	678 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MSE1	P48525	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	SAY1	P53324	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CUZ1	P53899	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YAT1	P80235	687 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	TDA1	Q03533	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	TRS23	Q03784	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MSS11	Q03825	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	HLR1	Q04429	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	BUR2	Q05949	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	GPN3	Q06543	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	FRE6	Q12473	712 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YOS9	Q99220	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MSN1	P22148	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CWH43	P25618	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MSN4	P33749	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
DED81	YHR019C	LST4	P34239	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	IRC18	P47056	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PMT5	P52867	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	DCR2	Q05924	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	AIM6	Q07716	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PIN2	Q12057	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RTN2	Q12443	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	SFG1	Q12507	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	SET6	Q12529	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PDE2	P06776	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	HMG1	P12683	1054 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	DOA4	P32571	926 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	SEF1	P34228	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
DED81	YHR019C	SRL3	P36167	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CUP9	P41817	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PMT6	P42934	759 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	BRR6	P53062	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	ATG41	Q12048	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	FRE7	Q12333	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CDC9	P04819	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	GCN3	P14741	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CPR2	P23285	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	VPS17	P32913	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MTH1	P35198	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CCZ1	P38273	704 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	CHS7	P38843	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MLH1	P38920	769 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	UME6	P39001	836 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	RTT105	P40063	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YKE4	P40544	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PMT3	P47190	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	ERV29	P53337	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PFA5	Q03289	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	PLB2	Q03674	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	SNX41	Q04053	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	COX20	Q04935	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	TPO3	Q06451	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	IRC19	Q07843	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DED81	YHR019C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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