RNA–Protein interactions for RNA: YKL208W

CBT1, Transcript of Protein involved in 5' RNA end processing, yeast

Gene CBT1, Length 816 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBT1	YKL208W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MCH2	P36032	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	REE1	P40893	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YJL118W	P47022	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	TAD2	P47058	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	TLG1	Q03322	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	BSC6	Q08280	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SLM3	Q12093	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ERD1	P16151	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PET123	P17558	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	GIT1	P25346	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CWP1	P28319	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	URA10	P30402	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PEP1	P32319	1579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CSE1	P33307	960 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	DDI1	P40087	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	AIM23	P47015	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	BIO3	P50277	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CPD1	P53314	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SUR7	P54003	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	KRE28	Q04431	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PAM18	Q07914	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	RSA1	Q08932	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	BUD4	P47136	1447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	STE7	P06784	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MSN4	P33749	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	COA1	P40452	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SLM1	P40485	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	UBC13	P52490	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	POM33	Q12164	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ATG31	Q12421	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SAC3	P46674	1301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	REV3	P14284	1504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ATG2	P53855	1592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	CDC42	P19073	191 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	KRE6	P32486	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	YAT2	P40017	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	MSS2	P40990	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	BIR1	P47134	954 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	TIM21	P53220	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	PGA2	P53903	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SLT2	Q00772	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CBT1	YKL208W	INO2	P26798	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	DOA4	P32571	926 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PAN6	P40459	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YGR210C	P42942	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	OTU1	P43558	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	FAR10	Q06001	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	FDH1	Q08911	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	PLP2	Q12017	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	ATP16	Q12165	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TFC7	Q12415	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	IZH2	Q12442	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YOS9	Q99220	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	MDS3	P53094	1487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TFS1	P14306	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
CBT1	YKL208W	SHC1	P39000	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YER186C	P40101	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	GDS1	P41913	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CRH1	P53301	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	VBA1	Q04301	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TAF10	Q12030	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	CSE2	P33308	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	AIM29	P36154	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	EGT2	P42835	1041 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	ATG18	P43601	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TIS11	P47977	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	GTO3	Q04806	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	MFG1	Q07684	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	MHP1	P43638	1398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CBT1	YKL208W	SIN3	P22579	1536 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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