RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W GRS2Q06817 618 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W HNT3Q08702 217 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SLM3Q12093 417 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W FRE8Q12209 686 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W HMS1Q12398 434 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W YDL199CQ12407 687 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W GIS3Q12418 502 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W PRM4Q12498 284 aa2.67□□□□□ -1.98
RTT105YER104W HIS1P00498 297 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W MSI1P13712 422 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W RPB5P20434 215 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W PDC2P32896 925 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W CSE1P33307 960 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SIP3P38717 1229 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W GDS1P41913 522 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W TIS11P47977 285 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W UBC13P52490 153 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SHY1P53266 389 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SUR7P54003 302 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W OST6Q03723 332 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SCW10Q04951 389 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W YPR172WQ06608 200 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W TMS1Q12116 473 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W POM33Q12164 279 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W MSH5Q12175 901 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W YPR064WQ12492 139 aa2.66□□□□□ -1.98
RTT105YER104W SAL1D6W196 494 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W NAM2P11325 894 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W CBS2P14905 389 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MER1P16523 270 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W DEP1P31385 405 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W LDB7P38210 180 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W CWC25P53854 179 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data2.65□□□□□ -1.99not detected
RTT105YER104W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W BNA7Q04066 261 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W VBA1Q04301 562 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RIF2Q06208 395 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W NDD1Q08887 554 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.65□□□□□ -1.99
RTT105YER104W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MATALPHA1P0CY06 175 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W HMLALPHA1P0CY07 175 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W TFS1P14306 219 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W ERD1P16151 362 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RPS5P26783 225 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W PPA2P28239 310 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W IES6P32617 166 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MRPL6P32904 214 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MAL32P38158 584 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YIL067CP40514 678 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MOB2P43563 287 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W HIT1P46973 164 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W AIM23P47015 356 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W VHT1P53241 593 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MAL12P53341 584 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W CRZ1P53968 678 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YOR387CQ08910 206 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RSA1Q08932 381 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W CSM4Q08955 156 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W PPT2Q12036 173 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W SFM1Q12314 213 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W JID1Q12350 301 aa2.64□□□□□ -1.99
RTT105YER104W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W REV1P12689 985 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W COQ1P18900 473 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W ZRC1P20107 442 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RPO26P20435 155 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W IFM1P25038 676 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W PBN1P25580 416 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W CPR3P25719 182 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W INO2P26798 304 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W LDS1P31379 325 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W MRX3P38172 270 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YPC1P38298 316 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W NDT80P38830 627 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W PFS1P38872 237 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W SHC1P39000 512 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W RPL10P41805 221 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W ASG7P46993 209 aa2.63□□□□□ -1.99
RTT105YER104W YPT32P51996 222 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
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