RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W EFM5P53200 248 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YMR010WQ03687 405 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W ROY1Q04847 553 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YMR321CQ04898 105 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W GRS2Q06817 618 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W YOL019WQ08157 551 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W PST2Q12335 198 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W RTR2Q12378 196 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W MHF2Q3E829 80 aa4.34□□□□□ -1.71
PRD1YCL057W COX5AP00424 153 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W ADE4P04046 510 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W HEM2P05373 342 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W GLK1P17709 500 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W PEX34P25584 144 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W AFG1P32317 509 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SPT14P32363 452 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W VMA8P32610 256 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MRPL6P32904 214 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SKT5P34226 696 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W ZRT3P34240 503 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W FRE2P36033 711 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MRP21P38175 177 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SRP72P38688 640 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MNN9P39107 395 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SER3P40054 469 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YJL068CP40363 299 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SSU1P41930 458 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RPS12P48589 143 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W GOT1Q03554 138 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YLR413WQ06689 675 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W JLP1Q12358 412 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W CSR2Q12734 1121 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RIB3Q99258 208 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SPS4P09937 338 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W ATG22P25568 528 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YPT32P51996 222 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W BOL2P53082 120 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W TPN1P53099 579 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MRH4P53166 561 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W HER2Q03557 464 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W DDC1Q08949 612 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W GPM2Q12008 311 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YDR061WQ12298 539 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RPN6Q12377 434 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YPR1Q12458 312 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W CTF3Q12748 733 aa4.33□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MES1P00958 751 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W DST1P07273 309 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SEC62P21825 274 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W GRR1P24814 1151 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YCR099CP25657 155 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W COX13P32799 129 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W CAF4P36130 643 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W PIM1P36775 1133 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W THI2P38141 450 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YHR054CP38780 354 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W IRC18P47056 224 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SNX4P47057 423 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W IMP4P53941 290 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W KAP120Q02932 1032 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W EMI1Q04406 187 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SWC7Q06707 132 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W UAF30Q08747 228 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W ATP16Q12165 160 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MDM32Q12171 622 aa4.32□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RAS2P01120 322 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W STE3P06783 470 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W ATP10P18496 279 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W TAF14P35189 244 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W ARA1P38115 344 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W EFM1P38732 585 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W LSM12P38828 187 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W VPS52P39904 641 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YER034WP40022 185 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W PRM8P53174 237 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W PEX31P53203 462 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W NUP53Q03790 475 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W COS7Q07788 383 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W YNG1Q08465 219 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RKM5Q12367 367 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W SNF8Q12483 233 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RMD5Q12508 421 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W HOM3P10869 527 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W AAT2P23542 418 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W JEN1P36035 616 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W RRP3P38712 501 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W MLH1P38920 769 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W PRM9P39551 298 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W HAT2P39984 401 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W DDI1P40087 428 aa4.31□□□□□ -1.72
PRD1YCL057W FAU1P40099 211 aa4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms