RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	EXO1	P39875	702 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MNN5	P46982	586 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YJL043W	P47053	257 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SNX4	P47057	423 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	NBP35	P52920	328 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MPS2	P53159	387 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YGR015C	P53208	328 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YGR079W	P53249	370 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	AAT1	Q01802	451 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GIP3	Q03016	1276 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	CCE1	Q03702	353 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ARO10	Q06408	635 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PEX27	Q08580	376 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	NDD1	Q08887	554 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YOR387C	Q08910	206 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ATG29	Q12092	213 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RTR2	Q12378	196 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MRX4	Q12467	430 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	DAL81	P21657	970 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PEX34	P25584	144 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RPC34	P32910	317 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PIM1	P36775	1133 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SOL2	P37262	315 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MDM31	P38880	579 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	NVJ1	P38881	321 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RCY1	P39531	840 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LAS21	P40367	830 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GDS1	P41913	522 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YGR201C	P42936	225 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	IRC7	P43623	340 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MDV1	P47025	714 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	UBX6	P47049	396 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	IRC18	P47056	224 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YJR030C	P47101	745 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YJR149W	P47177	404 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	FRE4	P53746	719 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	OAZ1	Q02803	292 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PIR1	Q03178	341 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	BSP1	Q06604	576 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RAX1	Q08760	435 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YPL199C	Q08954	240 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MSF1	P08425	469 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MER1	P16523	270 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ATG22	P25568	528 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GSH1	P32477	678 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PMT1	P33775	817 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RSM22	P36056	628 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SBE22	P38814	852 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MLH1	P38920	769 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PSD1	P39006	500 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	CCT6	P39079	546 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	VMA7	P39111	118 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YGR210C	P42942	411 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SUN4	P53616	420 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PRM1	P53835	661 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YSA1	Q01976	231 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YPL014W	Q02606	381 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MRPS16	Q02608	121 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YMR087W	Q04299	284 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ARG7	Q04728	441 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PHO92	Q06390	306 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YPR011C	Q12251	326 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YDR061W	Q12298	539 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LAG2	Q92325	660 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SRN2	Q99176	213 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YOR019W	Q99248	730 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	CDC43	P18898	376 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	NDC1	P32500	655 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GCS1	P35197	352 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	NAT2	P37293	288 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MUM2	P38236	366 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YBR242W	P38331	238 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	TIM17	P39515	158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YIR016W	P40572	265 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	IMO32	P53219	342 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YGR067C	P53243	804 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MRPL19	P53875	158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RIM13	Q03792	727 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	AIM36	Q03798	255 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GIS1	Q03833	894 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57

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