RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W COR1P07256 457 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TRK2P28584 889 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W GCD10P41814 478 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PMT6P42934 759 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PET191Q02772 108 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W USA1Q03714 838 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ARP10Q04549 284 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RAF1Q06891 181 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W LDB17Q12342 491 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MMM1P41800 426 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W LOH1P47055 219 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W VEL1P53058 206 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ROG1P53118 685 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SOV1Q04748 898 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FRE5Q08908 694 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YDL180WQ12301 547 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YER175W-AQ8TGU4 54 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SPS100P13130 326 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W VPS33P20795 691 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SPT10P35208 640 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PFA3P42836 336 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PLM2Q04383 521 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W BCH1Q05029 724 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TDA6Q06466 467 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YPR078CQ06813 372 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W COS7Q07788 383 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YOR214CQ12282 236 aa2.6□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ARG81P05085 880 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RPS23BP0CX30 145 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PMR1P13586 950 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YSP3P25036 478 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TRS20P38334 175 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W ALG8P40351 577 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FUS2Q05670 677 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RHO2P06781 192 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SAG1P20840 650 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W SSO1P32867 290 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W FLO5P38894 1075 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W AVT1P47082 602 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W YIP1P53039 248 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W KAP114P53067 1004 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PIR3Q03180 325 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W CRN1Q06440 651 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W RRT8Q08219 342 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W TGS1Q12052 315 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W PER33Q12144 273 aa2.59□□□□□ -1.99
SIN3YOL004W MRP10O75012 95 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W STE7P06784 515 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W YHB1P39676 399 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W SNL1P40548 159 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W YIR014WP40570 242 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W TDA10P42938 290 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W ASI2P53895 289 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W PET117Q02771 107 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W RSN1Q03516 953 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W YPR022CQ12139 1133 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W YBR255C-AQ3E776 120 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W ECM3Q99252 613 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W CIN4P39110 191 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W NBP35P52920 328 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W LSG1P53145 640 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W RIM9Q04734 239 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W ARR2Q06597 130 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W MRPL35Q06678 367 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W PEX27Q08580 376 aa2.59□□□□□ -2
SIN3YOL004W VPS63O13549 108 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W UTR1P21373 530 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W CMK2P22517 447 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W YIL077CP40508 320 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W GIP3Q03016 1276 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W CRT10Q08226 957 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W INA22P40576 216 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W MRX5P47007 382 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W WSC2P53832 503 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W PIR1Q03178 341 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W ACL4Q03771 387 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W MSS11Q03825 758 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W PDR8Q06149 701 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W ACF2Q12168 779 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W GIS3Q12418 502 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W PEP5P12868 1029 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W UNG1P12887 359 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms