RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	LOT6	Q07923	191 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	LAG2	Q92325	660 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	COX2	P00410	251 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	OPI3	P05375	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	STE18	P18852	110 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MXR2	P25566	168 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	ATP7	P30902	174 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SKT5	P34226	696 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MYO3	P36006	1272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	FRE2	P36033	711 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	YBR056W	P38081	501 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SUR2	P38992	349 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	MTW1	P39731	289 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	HMS2	P47175	358 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	TAF6	P53040	516 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	SMP3	Q04174	516 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NEM1	YHR004C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	TPK3	P05986	398 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RBK1	P25332	333 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RRT12	P25381	491 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
NEM1	YHR004C	RBG1	P39729	369 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RRT5	P43607	289 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
NEM1	YHR004C	GPI15	P53961	229 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	GIM5	Q04493	163 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	NAT4	Q04751	285 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SMC5	Q08204	1093 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SGT1	Q08446	395 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.33	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.32	□□□□□ -1.88	not detected
NEM1	YHR004C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	CTR86	P25355	563 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	DCC1	P25559	380 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MRPS5	P33759	307 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	LDB7	P38210	180 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	STP2	P38704	541 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	DSE1	P40077	573 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YIL001W	P40560	513 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	AGP3	P43548	558 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SSN8	P47821	323 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PCP1	P53259	346 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	HER2	Q03557	464 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YDL144C	Q07589	356 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SRO7	Q12038	1033 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.32	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YAK1	P14680	807 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ERG9	P29704	444 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	NUP2	P32499	720 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	VAM7	P32912	316 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	BIG1	P38813	335 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PFS1	P38872	237 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	NAS6	P50086	228 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	MKC7	P53379	596 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SPR6	Q01684	191 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	SPO77	Q06134	477 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ASA1	Q06822	443 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	VIK1	Q12045	647 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YOP1	Q12402	180 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.31	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.3	□□□□□ -1.88
NEM1	YHR004C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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