RNA–Protein interactions for RNA: YGR041W

BUD9, Transcript of Protein involved in bud-site selection, yeast

Gene BUD9, Length 1,644 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD9	YGR041W	MKC7	P53379	596 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	YAP7	Q08182	245 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	YPQ1	Q12010	308 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	DAS2	Q12084	232 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	ERP3	Q12403	225 aa		5.84	□□□□□ -1.47
BUD9	YGR041W	FIG2	P25653	1609 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SPL2	P38839	148 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	VRG4	P40107	337 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	COA1	P40452	197 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	LIF1	P53150	421 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	OKP1	P53298	406 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	NUP100	Q02629	959 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	HER2	Q03557	464 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	KRE28	Q04431	385 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	MSH5	Q12175	901 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YOP1	Q12402	180 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RRI1	Q12468	440 aa		5.83	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	FAR1	P21268	830 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	APA2	P22108	325 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	IST2	P38250	946 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	APD1	P38281	316 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	FRE4	P53746	719 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	BET5	Q03630	159 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	LAG2	Q92325	660 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	EXO70	P19658	623 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YMC1	P32331	307 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	ATG7	P38862	630 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	GLG2	P47011	380 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RMR1	P53060	241 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	LST7	P53237	242 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RRN9	P53437	365 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SPO77	Q06134	477 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RBK1	P25332	333 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YGR210C	P42942	411 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	AZR1	P50080	613 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SED5	Q01590	340 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	BSP1	Q06604	576 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	DAP1	Q12091	152 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	ACF2	Q12168	779 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	NCA2	Q12374	616 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SEY1	Q99287	776 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	TUS1	Q06412	1307 aa		5.81	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	MYO1	P08964	1928 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	ATP6	P00854	259 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	PHD1	P36093	366 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	OMA1	P36163	345 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	TDA11	P38854	504 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RBG1	P39729	369 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YFH7	P43591	353 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SPR6	Q01684	191 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	NUP116	Q02630	1113 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YPL080C	Q02826	108 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	IRC4	Q03036	179 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	TPO3	Q06451	622 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	DSE3	Q08729	430 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	PFA4	Q12006	378 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	APC9	Q12107	265 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	ARP6	Q12509	438 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SET6	Q12529	373 aa		5.8	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	STE18	P18852	110 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	CDC43	P18898	376 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	CKA2	P19454	339 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	DCC1	P25559	380 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	ERG9	P29704	444 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	PTR2	P32901	601 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RSM22	P36056	628 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	RIB1	P38066	345 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SIM1	P40472	476 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SLM1	P40485	686 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YNR048W	P53740	393 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	MSS11	Q03825	758 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	CAC2	Q04199	468 aa		5.79	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	REV1	P12689	985 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	FRE2	P36033	711 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	TIM44	Q01852	431 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	GIM5	Q04493	163 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	BNA5	Q05979	453 aa		5.78	□□□□□ -1.48
BUD9	YGR041W	SRO7	Q12038	1033 aa		5.78	□□□□□ -1.48

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