RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W TEC1P18412 486 aa9□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W YBL036CP38197 257 aa9□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W FIG4P42837 879 aa9□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W UGA3P26370 528 aa8.97□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W GUT2P32191 649 aa8.95□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W PKC1P24583 1151 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W EMW1P42842 904 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W YJR115WP47152 169 aa8.92□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W YPR084WQ06821 456 aa8.91□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W STE20Q03497 939 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W SRF1Q12516 437 aa8.9□□□□□ -0.98
YKR104WYKR104W YBL086CP38177 466 aa8.89□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W MRX12P47084 519 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W APP1P53933 587 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W FRA1Q07825 749 aa8.88□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W PTK2P47116 818 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W ENV9Q08651 330 aa8.87□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W MET22P32179 357 aa8.85□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W MKS1P34072 584 aa8.85□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W YPP1P46951 817 aa8.85□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W ITT1Q04638 464 aa8.85□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W ARG82P07250 355 aa8.84□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W MCM16Q12262 181 aa8.84□□□□□ -0.99
YKR104WYKR104W BIO2P32451 375 aa8.83□□□□□ -1
YKR104WYKR104W YDR444WQ04093 687 aa8.83□□□□□ -1
YKR104WYKR104W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
YKR104WYKR104W YLR346CQ06139 101 aa8.82□□□□□ -1
YKR104WYKR104W NUP85P46673 744 aa8.81□□□□□ -1
YKR104WYKR104W YJL007CP47080 104 aa8.81□□□□□ -1
YKR104WYKR104W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
YKR104WYKR104W SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
YKR104WYKR104W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.8□□□□□ -1not detected
YKR104WYKR104W GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
YKR104WYKR104W FBP26P32604 452 aa8.8□□□□□ -1
YKR104WYKR104W EMP47P43555 445 aa8.8□□□□□ -1
YKR104WYKR104W ATG20Q07528 640 aa8.8□□□□□ -1
YKR104WYKR104W ATG3P40344 310 aa8.79□□□□□ -1
YKR104WYKR104W AAD14P42884 376 aa8.79□□□□□ -1
YKR104WYKR104W YNL108CP53929 270 aa8.79□□□□□ -1
YKR104WYKR104W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YKR104WYKR104W DFG5Q05031 458 aa8.78□□□□□ -1
YKR104WYKR104W BDS1Q08347 646 aa8.78□□□□□ -1
YKR104WYKR104W ISF1P32488 338 aa8.76□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W STE6P12866 1290 aa8.75□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W LSC2P53312 427 aa8.75□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W ISU1Q03020 165 aa8.75□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W ENO2P00925 437 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W BIM1P40013 344 aa8.74□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W APL6P46682 809 aa8.74□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W OPT2Q06593 877 aa8.73□□□□□ -1.01
YKR104WYKR104W MIP1P15801 1254 aa8.71□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W GLY1P37303 387 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W RIM21P48565 533 aa8.71□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W DMA2P53924 522 aa8.71□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W ATG32P40458 529 aa8.7□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W UBP2Q01476 1272 aa8.69□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W DLD3P39976 496 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W YJR098CP47139 656 aa8.68□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W SCW11P53189 542 aa8.67□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W YPL062WQ02781 134 aa8.67□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W RTG2P32608 588 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W DLD1P32891 587 aa8.66□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W SOH1P38633 127 aa8.66□□□□□ -1.02
YKR104WYKR104W UTR2P32623 467 aa8.64□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W TBS1P38114 1094 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W RGA1P39083 1007 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W ACO2P39533 789 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W MRX10Q05648 414 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W TCB1Q12466 1186 aa8.63□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W DAT1P13483 248 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W WTM2Q12206 467 aa8.62□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W TY1A-BLQ12266 440 aa8.62□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W ENO1P00924 437 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W HAL5P38970 855 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W VTC4P47075 721 aa8.6□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W RDS2P19541 446 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W YDL176WQ12027 708 aa8.59□□□□□ -1.03
YKR104WYKR104W SIS2P36024 562 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W CAF120P53836 1060 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W HDA3Q06623 655 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W YPR204WQ08995 1032 aa8.58□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W OSH7P38755 437 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W YFL034WP43564 1073 aa8.56□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W DAL1P32375 460 aa8.55□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W SLX8P40072 274 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data8.54□□□□□ -1.04not detected
YKR104WYKR104W MSN5P52918 1224 aa8.53□□□□□ -1.04
YKR104WYKR104W PEP12P32854 288 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W YIR007WP40566 764 aa8.52□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W AIM9P40053 627 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W SUM1P46676 1062 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W ROG3P43602 733 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR104WYKR104W CDC19P00549 500 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.2 ms