RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073961.7

Ptpre-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpre, Length 5,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rock1P70335 1354 aa21.75■■□□□ 1.07
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.75■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ecm2Q5FW85 670 aa21.74■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Psme1P97371 249 aa21.74■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa21.73■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa21.73■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Becn1O88597 448 aa21.72■■□□□ 1.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tsen2Q6P7W5 460 aa21.71■■□□□ 1.07
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fam184bQ0KK56 942 aa21.62■■□□□ 1.05
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Kif7B7ZNG0 1348 aa21.6■■□□□ 1.05
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cux1P53564 1515 aa21.58■■□□□ 1.04
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gpatch11Q3UFS4 262 aa21.57■■□□□ 1.04
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Kif16bB1AVY7 1312 aa21.56■■□□□ 1.04
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zscan10Q3URR7 782 aa21.56■■□□□ 1.04
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Filip1lQ6P6L0 1131 aa21.56■■□□□ 1.04
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trim58Q5NCC9 485 aa21.55■■□□□ 1.04
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ccer1Q9CQL2 403 aa21.55■■□□□ 1.04
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa21.52■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Esx1O88933 382 aa21.51■■□□□ 1.03
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rabep1O35551 862 aa21.51■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Nap1l3Q794H2 544 aa21.5■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Taok2Q6ZQ29 1240 aa21.48■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tpd52l1O54818 204 aa21.48■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vps8Q0P5W1 1427 aa21.47■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.47■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 WrnO09053 1401 aa21.47■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa21.47■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ncoa2Q61026 1462 aa21.47■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 KinQ8K339 391 aa21.46■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rfx1P48377 963 aa21.46■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ciz1Q8VEH2 845 aa21.46■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Atl3Q91YH5 541 aa21.46■■□□□ 1.03
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ap3b2Q9JME5 1082 aa21.45■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Map7d2A2AG50 781 aa21.45■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ccdc30Q8BVF4 654 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf710Q3U288 666 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa21.42■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Kif4P33174 1231 aa21.41■■□□□ 1.02
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gripap1Q8VD04 806 aa21.39■■□□□ 1.02
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Ptpre-201ENSMUST00000073961 Triml2E9PW10 424 aa21.38■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cabp4Q8VHC5 271 aa21.37■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa21.36■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.36■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tdrd9Q14BI7 1383 aa21.36■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cetn4Q8K4K1 168 aa21.35■■□□□ 1.01
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Mink1Q9JM52 1308 aa21.35■■□□□ 1.01
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