Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC57,77■■■■■ 6,84
Vps8Q0P5W1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53,59■■■■■ 6,17
Vps8Q0P5W1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,63■■■■■ 6,02
Vps8Q0P5W1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC50,35■■■■■ 5,65
Vps8Q0P5W1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC50,21■■■■■ 5,63
Vps8Q0P5W1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,13■■■■■ 5,61
Vps8Q0P5W1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC49,22■■■■■ 5,47
Vps8Q0P5W1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,99■■■■■ 5,43
Vps8Q0P5W1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,83■■■■■ 5,41
Vps8Q0P5W1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,66■■■■■ 5,38
Vps8Q0P5W1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,42■■■■■ 5,34
Vps8Q0P5W1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC48,32■■■■■ 5,33
Vps8Q0P5W1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48,14■■■■■ 5,3
Vps8Q0P5W1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,07■■■■■ 5,29
Vps8Q0P5W1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,1■■■■■ 5,13
Vps8Q0P5W1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46,88■■■■■ 5,09
Vps8Q0P5W1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,84■■■■■ 5,09
Vps8Q0P5W1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46,61■■■■■ 5,05
Vps8Q0P5W1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46,57■■■■■ 5,05
Vps8Q0P5W1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46,35■■■■■ 5,01
Vps8Q0P5W1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,33■■■■■ 5,01
Vps8Q0P5W1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC46,3■■■■■ 5
Vps8Q0P5W1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46,3■■■■■ 5
Vps8Q0P5W1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,15■■■■■ 4,98
Vps8Q0P5W1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,11■■■■■ 4,97
Vps8Q0P5W1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,99■■■■■ 4,95
Vps8Q0P5W1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,92■■■■■ 4,94
Vps8Q0P5W1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,91■■■■■ 4,94
Vps8Q0P5W1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
Vps8Q0P5W1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,8■■■■■ 4,92
Vps8Q0P5W1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,78■■■■■ 4,92
Vps8Q0P5W1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45,72■■■■■ 4,91
Vps8Q0P5W1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,71■■■■■ 4,91
Vps8Q0P5W1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45,66■■■■■ 4,9
Vps8Q0P5W1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45,61■■■■■ 4,89
Vps8Q0P5W1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,58■■■■■ 4,89
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,45■■■■■ 4,87
Vps8Q0P5W1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44,85■■■■■ 4,77
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44,84■■■■■ 4,77
Vps8Q0P5W1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,82■■■■■ 4,77
Vps8Q0P5W1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,68■■■■■ 4,74
Vps8Q0P5W1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
Vps8Q0P5W1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44,49■■■■■ 4,71
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,46■■■■■ 4,71
Vps8Q0P5W1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44,37■■■■■ 4,69
Vps8Q0P5W1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44,35■■■■■ 4,69
Vps8Q0P5W1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44,24■■■■■ 4,67
Vps8Q0P5W1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Vps8Q0P5W1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,05■■■■■ 4,64
Vps8Q0P5W1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC44,04■■■■■ 4,64
Vps8Q0P5W1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43,98■■■■■ 4,63
Vps8Q0P5W1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Vps8Q0P5W1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Vps8Q0P5W1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43,78■■■■■ 4,6
Vps8Q0P5W1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43,76■■■■■ 4,6
Vps8Q0P5W1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43,64■■■■■ 4,58
Vps8Q0P5W1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Vps8Q0P5W1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
Vps8Q0P5W1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
Vps8Q0P5W1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43,33■■■■■ 4,53
Vps8Q0P5W1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43,28■■■■■ 4,52
Vps8Q0P5W1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43,19■■■■■ 4,5
Vps8Q0P5W1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,13■■■■■ 4,5
Vps8Q0P5W1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Vps8Q0P5W1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,1■■■■■ 4,49
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43,07■■■■■ 4,48
Vps8Q0P5W1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC43,04■■■■■ 4,48
Vps8Q0P5W1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Vps8Q0P5W1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Vps8Q0P5W1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,98■■■■■ 4,47
Vps8Q0P5W1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Vps8Q0P5W1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,92■■■■■ 4,46
Vps8Q0P5W1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42,9■■■■■ 4,46
Vps8Q0P5W1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Vps8Q0P5W1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Vps8Q0P5W1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Vps8Q0P5W1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Vps8Q0P5W1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42,8■■■■■ 4,44
Vps8Q0P5W1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Vps8Q0P5W1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Vps8Q0P5W1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Vps8Q0P5W1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Vps8Q0P5W1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42,64■■■■■ 4,42
Vps8Q0P5W1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42,63■■■■■ 4,41
Vps8Q0P5W1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,61■■■■■ 4,41
Vps8Q0P5W1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Vps8Q0P5W1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Vps8Q0P5W1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42,59■■■■■ 4,41
Vps8Q0P5W1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Vps8Q0P5W1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
Vps8Q0P5W1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42,4■■■■■ 4,38
Vps8Q0P5W1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
Vps8Q0P5W1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,38■■■■■ 4,38
Vps8Q0P5W1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,37■■■■■ 4,37
Vps8Q0P5W1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
Vps8Q0P5W1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Vps8Q0P5W1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,2■■■■■ 4,35
Vps8Q0P5W1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Vps8Q0P5W1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms