Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,12■■■■■ 5,13
Chmp3Q9CQ10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,52■■■■■ 4,56
Chmp3Q9CQ10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Chmp3Q9CQ10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,3■■■■■ 4,2
Chmp3Q9CQ10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Chmp3Q9CQ10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,73■■■■■ 4,11
Chmp3Q9CQ10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,38■■■■■ 4,05
Chmp3Q9CQ10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Chmp3Q9CQ10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Chmp3Q9CQ10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,81■■■■□ 3,96
Chmp3Q9CQ10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Chmp3Q9CQ10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Chmp3Q9CQ10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,37■■■■□ 3,89
Chmp3Q9CQ10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Chmp3Q9CQ10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Chmp3Q9CQ10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38,5■■■■□ 3,75
Chmp3Q9CQ10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Chmp3Q9CQ10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Chmp3Q9CQ10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Chmp3Q9CQ10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Chmp3Q9CQ10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,99■■■■□ 3,67
Chmp3Q9CQ10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Chmp3Q9CQ10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,92■■■■□ 3,66
Chmp3Q9CQ10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Chmp3Q9CQ10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,66
Chmp3Q9CQ10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Chmp3Q9CQ10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Chmp3Q9CQ10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
Chmp3Q9CQ10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Chmp3Q9CQ10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Chmp3Q9CQ10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Chmp3Q9CQ10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Chmp3Q9CQ10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Chmp3Q9CQ10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,13■■■■□ 3,53
Chmp3Q9CQ10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,11■■■■□ 3,53
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3,51
Chmp3Q9CQ10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Chmp3Q9CQ10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Chmp3Q9CQ10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Chmp3Q9CQ10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Chmp3Q9CQ10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Chmp3Q9CQ10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Chmp3Q9CQ10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Chmp3Q9CQ10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Chmp3Q9CQ10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Chmp3Q9CQ10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Chmp3Q9CQ10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Chmp3Q9CQ10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,19■■■■□ 3,38
Chmp3Q9CQ10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Chmp3Q9CQ10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Chmp3Q9CQ10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Chmp3Q9CQ10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Chmp3Q9CQ10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Chmp3Q9CQ10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Chmp3Q9CQ10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Chmp3Q9CQ10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Chmp3Q9CQ10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Chmp3Q9CQ10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,54■■■■□ 3,28
Chmp3Q9CQ10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,52■■■■□ 3,28
Chmp3Q9CQ10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Chmp3Q9CQ10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Chmp3Q9CQ10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Chmp3Q9CQ10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Chmp3Q9CQ10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Chmp3Q9CQ10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Chmp3Q9CQ10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Chmp3Q9CQ10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Chmp3Q9CQ10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Chmp3Q9CQ10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Chmp3Q9CQ10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Chmp3Q9CQ10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Chmp3Q9CQ10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Chmp3Q9CQ10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Chmp3Q9CQ10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35,2■■■■□ 3,23
Chmp3Q9CQ10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Chmp3Q9CQ10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Chmp3Q9CQ10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Chmp3Q9CQ10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Chmp3Q9CQ10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Chmp3Q9CQ10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
Chmp3Q9CQ10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Chmp3Q9CQ10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Chmp3Q9CQ10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Chmp3Q9CQ10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,87■■■■□ 3,17
Chmp3Q9CQ10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Chmp3Q9CQ10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Chmp3Q9CQ10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Chmp3Q9CQ10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Chmp3Q9CQ10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Chmp3Q9CQ10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Chmp3Q9CQ10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Chmp3Q9CQ10 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Chmp3Q9CQ10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Chmp3Q9CQ10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Chmp3Q9CQ10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Chmp3Q9CQ10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,53■■■■□ 3,12
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