Protein–RNA interactions for Protein: P33174

Kif4, Chromosome-associated kinesin KIF4, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif4P33174 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Kif4P33174 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Kif4P33174 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Kif4P33174 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kif4P33174 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Kif4P33174 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Kif4P33174 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Kif4P33174 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kif4P33174 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kif4P33174 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kif4P33174 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kif4P33174 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kif4P33174 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kif4P33174 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kif4P33174 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kif4P33174 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kif4P33174 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kif4P33174 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Kif4P33174 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Kif4P33174 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Kif4P33174 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Kif4P33174 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Kif4P33174 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kif4P33174 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Kif4P33174 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kif4P33174 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Kif4P33174 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Kif4P33174 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Kif4P33174 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kif4P33174 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Kif4P33174 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kif4P33174 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kif4P33174 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kif4P33174 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kif4P33174 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kif4P33174 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kif4P33174 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kif4P33174 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Kif4P33174 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kif4P33174 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kif4P33174 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Kif4P33174 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Kif4P33174 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Kif4P33174 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kif4P33174 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kif4P33174 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kif4P33174 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kif4P33174 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Kif4P33174 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kif4P33174 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Kif4P33174 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kif4P33174 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kif4P33174 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kif4P33174 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kif4P33174 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kif4P33174 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kif4P33174 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kif4P33174 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kif4P33174 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kif4P33174 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kif4P33174 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Kif4P33174 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Kif4P33174 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kif4P33174 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kif4P33174 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kif4P33174 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kif4P33174 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kif4P33174 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kif4P33174 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kif4P33174 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Kif4P33174 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kif4P33174 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kif4P33174 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kif4P33174 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Kif4P33174 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kif4P33174 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Kif4P33174 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Kif4P33174 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Kif4P33174 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Kif4P33174 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Kif4P33174 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Kif4P33174 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kif4P33174 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kif4P33174 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kif4P33174 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kif4P33174 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kif4P33174 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kif4P33174 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kif4P33174 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kif4P33174 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kif4P33174 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kif4P33174 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Kif4P33174 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Kif4P33174 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Kif4P33174 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Kif4P33174 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Kif4P33174 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Kif4P33174 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Kif4P33174 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Kif4P33174 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms