RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W YIL166CP40445 542 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W STB1P42845 420 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RPA14P50106 137 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SPT20P50875 604 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W VPS73P53142 486 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YKR005CQ02203 525 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NCE101Q02820 53 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YLR173WQ06247 608 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YPS7Q06325 596 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W MLC2Q06580 163 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YOL036WQ08206 761 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YOR238WQ08634 303 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YDR061WQ12298 539 aa8.6□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RAS1P01119 309 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NFT1P0CE68 1218 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W TEC1P18412 486 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W ERD2P18414 219 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PHO80P20052 293 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W FAA1P30624 700 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SNC1P31109 117 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W SHE1P38200 338 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W FCY21P40039 528 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W MDE1P47095 244 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W RAI1P53063 387 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W NRM1P53718 249 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W PGA1P53896 198 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W TPP1Q03796 238 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W THP3Q12049 470 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YGR161W-CQ3E744 92 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W DFG16Q99234 619 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W FMP27Q06179 2628 aa8.59□□□□□ -1.03
BRR1YPR057W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W PRP28P23394 588 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W MKK2P32491 506 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W TIM12P32830 109 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SEC66P33754 206 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RRP4P38792 359 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data8.58□□□□□ -1.04not detected
BRR1YPR057W AIM20P40451 204 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W LEM3P42838 414 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W PFS2P42841 465 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SPG5P42933 373 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YJL055WP47044 245 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W IMD3P50095 523 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YGR067CP53243 804 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W MKC7P53379 596 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W FDC1Q03034 503 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YMR210WQ03649 449 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RSM24Q03976 319 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YPR127WQ06494 345 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W FRE5Q08908 694 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W GUP2Q08929 609 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RCN2Q12044 265 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YDL177CQ12257 170 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W NPC2Q12408 173 aa8.58□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W CDC31P06704 161 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W HSP30P25619 332 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YEF1P32622 495 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W MDL1P33310 695 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RIB7P33312 244 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W DML1Q03652 475 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SPC19Q03954 165 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W PLM2Q04383 521 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YDR514CQ04408 483 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SNO4Q04902 237 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W HSP32Q08992 237 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W REX3Q12090 404 aa8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W POL2P21951 2222 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SEC12P11655 471 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W HAP4P14064 554 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W GLK1P17709 500 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W PUP2P32379 260 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W MTC2P34246 357 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W JEN1P36035 616 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SKN7P38889 622 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W FMC1P40491 155 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W GDS1P41913 522 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W SEH1P53011 349 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YNR062CP53748 327 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YLR460CP54007 376 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W BRE4Q07660 1125 aa8.56□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YPK2P18961 677 aa8.55□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W FPS1P23900 669 aa8.55□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W PMT2P31382 759 aa8.55□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RSM22P36056 628 aa8.55□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W YHK8P38776 514 aa8.55□□□□□ -1.04
BRR1YPR057W RPP1P38786 293 aa8.55□□□□□ -1.04
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