RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.41	□□□□□ -2.02	not detected
YCT1	YLL055W	HEM14	P40012	539 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	SEC9	P40357	651 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	FLC3	P53121	802 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	RNH1	Q04740	348 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YLR177W	Q06251	628 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YLR413W	Q06689	675 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	SHS1	Q07657	551 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.41	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	MAS2	P11914	482 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	LDS1	P31379	325 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YUH1	P35127	236 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YFR018C	P43599	363 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	NUP84	P52891	726 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	APJ1	P53940	528 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	GRX3	Q03835	250 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YDR115W	Q04598	105 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	FSH2	Q05015	223 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	YOR338W	Q99326	363 aa		2.4	□□□□□ -2.02
YCT1	YLL055W	VPS63	O13549	108 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	SAG1	P20840	650 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	PSO2	P30620	661 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	PET100	P38958	111 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	END3	P39013	349 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YFL012W	P43580	148 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YHC3	P47040	408 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	RET3	P53600	189 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	TLG1	Q03322	224 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YLR297W	Q05899	129 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	IES4	Q08561	116 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	PEX27	Q08580	376 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ATP16	Q12165	160 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	APC2	Q12440	853 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	CCH1	P50077	2039 aa		2.4	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	MSK1	P32048	576 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	HMX1	P32339	317 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	PEX18	P38855	283 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YNL146W	P53906	100 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ABZ2	Q03266	374 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ECM18	Q04623	453 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	CUR1	Q06469	252 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	SFG1	Q12507	346 aa		2.39	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	STE2	D6VTK4	431 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	UNG1	P12887	359 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	GAL3	P13045	520 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	PDC2	P32896	925 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	VAM7	P32912	316 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	COS9	P36034	407 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YBR241C	P38142	488 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	CHL4	P38907	458 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	LOH1	P47055	219 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YGL114W	P53134	725 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	RNH201	P53942	307 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	ATC1	Q04005	294 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	APC4	Q04601	652 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	PIN3	Q06449	215 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YPR078C	Q06813	372 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	GLE1	Q12315	538 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	LDB17	Q12342	491 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.38	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	MAS1	P10507	462 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	UGA1	P17649	471 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	NTG1	P31378	399 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	COY1	P34237	679 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YKR015C	P36111	568 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	HSM3	P38348	480 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YHR182W	P38870	785 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YER184C	P39961	794 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	SNL1	P40548	159 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	AGX1	P43567	385 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	GTO1	P48239	356 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	VOA1	P53262	265 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	GAS2	Q06135	555 aa		2.37	□□□□□ -2.03
YCT1	YLL055W	YOR376W	Q08900	122 aa		2.37	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24 ms