RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	YMR262W	P38430	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SPT8	P38915	602 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YAT2	P40017	923 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	REE1	P40893	198 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YCH1	P42937	148 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YJR030C	P47101	745 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YGL185C	P53100	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	MST27	P53176	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	PBA1	Q05778	276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	FCY22	Q12119	530 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	TIP41	Q12199	356 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SIA1	Q12212	622 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	MYO4	P32492	1471 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YOR1	P53049	1477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ITR2	P30606	609 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ECM8	P38246	354 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CIN2	P46670	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	FMP16	Q12497	93 aa		4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	HEM4	P06174	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ECT1	P33412	323 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YBL059W	P34224	193 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SHE10	P53075	577 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	OKP1	P53298	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	JID1	Q12350	301 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	STH1	P32597	1359 aa		4.13	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	MDS3	P53094	1487 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	DAL2	P25335	343 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	FHL1	P39521	936 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ATC1	Q04005	294 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RIF2	Q06208	395 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RRT8	Q08219	342 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.12	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPO31	P04051	1460 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	NAM2	P11325	894 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	MRPL37	P36532	105 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YHR035W	P38769	630 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	NDT80	P38830	627 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YFR057W	P43625	151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YGL260W	P53056	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	BIO4	P53630	237 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YNL050C	P53952	270 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CSI1	Q04368	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	IRC25	Q07951	179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	FDH1	Q08911	376 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	HMS1	Q12398	434 aa		4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	GPI12	P23797	304 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	PRR1	P28708	518 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RCY1	P39531	840 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YNL320W	P42840	284 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YFL040W	P43562	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	KEL2	P50090	882 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	HCH1	P53834	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	BOR1	P53838	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	TRM82	Q03774	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	TMS1	Q12116	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	SPP41	P38904	1435 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	RAD7	P06779	565 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	MEI5	P32489	222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CSE2	P33308	149 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	HIS2	P38635	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	CTM1	P38818	585 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	PAN6	P40459	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
DSD1	YGL196W	NUP84	P52891	726 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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