RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	FYV6	P53913	173 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	ACS1	Q01574	713 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	INA17	Q02888	182 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YML037C	Q03703	340 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	ECM11	Q04110	302 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	PLM2	Q04383	521 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	RCO1	Q04779	684 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MFB1	Q04922	465 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YML053C	Q04978	212 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MFG1	Q07684	458 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	THP1	Q08231	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	ATX2	Q12067	313 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	UBX3	Q12229	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	STE3	P06783	470 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	CHS1	P08004	1131 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MSM1	P22438	575 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	COX13	P32799	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	SKT5	P34226	696 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	GEP4	P38812	185 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	BIG1	P38813	335 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YER184C	P39961	794 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	HAT2	P39984	401 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MPM1	P40364	252 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	ESL1	P40456	1118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	AYR1	P40471	297 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	TIR3	P40552	269 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	AAD10	P47182	288 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	PRM8	P53174	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	PEX31	P53203	462 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	POP6	P53218	158 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	COS1	P53822	381 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	IGO1	P53897	168 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	RRN5	Q02983	363 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YMD8	Q03697	442 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	AIM36	Q03798	255 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	EMI1	Q04406	187 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	BLS1	Q06071	122 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	CRN1	Q06440	651 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	ARR2	Q06597	130 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	SWA2	Q06677	668 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	GPM2	Q12008	311 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	NBP2	Q12163	236 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	SKM1	Q12469	655 aa		4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
POP4	YBR257W	HEM2	P05373	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	OCA4	P25366	362 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BEM1	P29366	551 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RNP1	P32385	249 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	UTR4	P32626	227 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PTM1	P32857	523 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SDH3	P33421	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TVP38	P36164	337 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MRP21	P38175	177 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RCK1	P38622	512 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YHR054C	P38780	354 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ECM27	P47144	725 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YGR067C	P53243	804 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	HHO1	P53551	258 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SPP2	Q02521	185 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SNX41	Q04053	625 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TRI1	Q05024	226 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RIF2	Q06208	395 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RRT8	Q08219	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	AEP3	Q12089	606 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.21	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GCN4	P03069	281 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PET54	P10834	293 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PHO80	P20052	293 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GRR1	P24814	1151 aa		4.2	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.1 ms