RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	POP2	P39008	433 aa		0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ECO1	P43605	281 aa		0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	UBX2	Q04228	584 aa		0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	DXO1	Q06349	442 aa		0.13	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CLC1	P17891	233 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.12	□□□□□ -2.39	not detected
snR46	snR46	DRE2	P36152	348 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	NRG2	P38082	220 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	SMF1	P38925	575 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ATM1	P40416	690 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	AIM23	P47015	356 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ROG1	P53118	685 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YDL109C	Q12103	647 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	MRX4	Q12467	430 aa		0.12	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ARG3	P05150	338 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TPK3	P05986	398 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TIP20	P33891	701 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YER084W	P40057	128 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YDR222W	Q04925	415 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	MMT2	Q08970	484 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TOM1	Q03280	3268 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	IRA2	P19158	3079 aa		0.11	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	VPS13	Q07878	3144 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TEL1	P38110	2787 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	CDC21	P06785	304 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	PHO80	P20052	293 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.1	□□□□□ -2.39	not detected
snR46	snR46	VID27	P40157	782 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.1	□□□□□ -2.39	not detected
snR46	snR46	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	DSK2	P48510	373 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	OCA2	P53949	197 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	SKO1	Q02100	647 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	KAP120	Q02932	1032 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	FEX1	Q08913	375 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	FEX2	Q08991	375 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YDR056C	Q12025	205 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	TFC7	Q12415	435 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.1	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
snR46	snR46	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	DOA1	P36037	715 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	TAE1	P38340	232 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RCK1	P38622	512 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	STE24	P47154	453 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	CAX4	P53223	239 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YNL095C	P53932	642 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YMR130W	Q04223	302 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	DCS1	Q06151	350 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YPL264C	Q08980	353 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	IES3	Q12345	250 aa		0.09	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	INO2	P26798	304 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YKR015C	P36111	568 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	FUI1	P38196	639 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	MED8	P38304	223 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	TPM2	P40414	161 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YIL054W	P40524	105 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YFR045W	P43617	309 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	HIT1	P46973	164 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	PMT5	P52867	743 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	INP1	Q03694	420 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	MMR1	Q06324	491 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	GRX6	Q12438	231 aa		0.08	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	COX3	P00420	269 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RPB9	P27999	122 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	ITR2	P30606	609 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	PMT2	P31382	759 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	ZRT3	P34240	503 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	DAN1	P47178	298 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	YMR244W	Q04018	355 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	ECM19	Q06011	112 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	CSF1	Q12150	2958 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	IRA1	P18963	3092 aa		0.07	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	CHD1	P32657	1468 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	CLB6	P32943	380 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	EFM1	P38732	585 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RRN9	P53437	365 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	ERO1	Q03103	563 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.06	□□□□□ -2.4
snR46	snR46	SIN3	P22579	1536 aa		0.06	□□□□□ -2.4

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms