Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.14■□□□□ 0.01
RDS3Q06835 NSR1YGR159C 1245 nt14.98□□□□□ -0.01
RDS3Q06835 NOP1YDL014W 984 nt14.78□□□□□ -0.04
RDS3Q06835 YKL036CYKL036C 393 nt13.75□□□□□ -0.21
RDS3Q06835 MDJ1YFL016C 1536 nt13.17□□□□□ -0.3
RDS3Q06835 Q0297Q0297 156 nt13□□□□□ -0.33
RDS3Q06835 SRX1YKL086W 384 nt12.93□□□□□ -0.34
RDS3Q06835 YJL027CYJL027C 417 nt12.84□□□□□ -0.35
RDS3Q06835 SCS3YGL126W 1143 nt12.57□□□□□ -0.4
RDS3Q06835 YCR051WYCR051W 669 nt12.25□□□□□ -0.45
RDS3Q06835 YOL085CYOL085C 342 nt11.91□□□□□ -0.5
RDS3Q06835 DBP2YNL112W 1641 nt11.73□□□□□ -0.53
RDS3Q06835 PKP1YIL042C 1185 nt11.69□□□□□ -0.54
RDS3Q06835 RPP1BYDL130W 321 nt11.65□□□□□ -0.54
RDS3Q06835 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.62□□□□□ -0.55
RDS3Q06835 CCC1YLR220W 969 nt11.47□□□□□ -0.57
RDS3Q06835 SCJ1YMR214W 1134 nt11.3□□□□□ -0.6
RDS3Q06835 ATS1YAL020C 1002 nt11.28□□□□□ -0.6
RDS3Q06835 YBR190WYBR190W 312 nt11.22□□□□□ -0.61
RDS3Q06835 PET122YER153C 765 nt11.11□□□□□ -0.63
RDS3Q06835 RVS167YDR388W 1449 nt11.03□□□□□ -0.64
RDS3Q06835 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.03□□□□□ -0.64
RDS3Q06835 SCR1SCR1 522 nt11.02□□□□□ -0.65
RDS3Q06835 RTC3YHR087W 336 nt10.95□□□□□ -0.66
RDS3Q06835 RRN5YLR141W 1092 nt10.81□□□□□ -0.68
RDS3Q06835 YDJ1YNL064C 1230 nt10.68□□□□□ -0.7
RDS3Q06835 SHR5YOL110W 714 nt10.68□□□□□ -0.7
RDS3Q06835 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.6□□□□□ -0.71
RDS3Q06835 RSB1YOR049C 1065 nt10.6□□□□□ -0.71
RDS3Q06835 PST2YDR032C 597 nt10.44□□□□□ -0.74
RDS3Q06835 GAR1YHR089C 618 nt10.4□□□□□ -0.74
RDS3Q06835 DEP1YAL013W 1218 nt10.31□□□□□ -0.76
RDS3Q06835 URN1YPR152C 1398 nt10.3□□□□□ -0.76
RDS3Q06835 YNL208WYNL208W 600 nt10.19□□□□□ -0.78
RDS3Q06835 RPN10YHR200W 807 nt10.18□□□□□ -0.78
RDS3Q06835 PUT4YOR348C 1884 nt10.17□□□□□ -0.78
RDS3Q06835 OPI9YLR338W 858 nt10.14□□□□□ -0.79
RDS3Q06835 YKL097CYKL097C 411 nt10.07□□□□□ -0.8
RDS3Q06835 TIR1YER011W 765 nt10.05□□□□□ -0.8
RDS3Q06835 SAH1YER043C 1350 nt10.03□□□□□ -0.8
RDS3Q06835 SHU1YHL006C 453 nt9.97□□□□□ -0.81
RDS3Q06835 ARE1YCR048W 1833 nt9.96□□□□□ -0.82
RDS3Q06835 SSA1YAL005C 1929 nt9.91□□□□□ -0.82
RDS3Q06835 POA1YBR022W 534 nt9.9□□□□□ -0.82
RDS3Q06835 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.87□□□□□ -0.83
RDS3Q06835 SSA3YBL075C 1950 nt9.85□□□□□ -0.83
RDS3Q06835 PUN1YLR414C 792 nt9.85□□□□□ -0.83
RDS3Q06835 YJR018WYJR018W 363 nt9.84□□□□□ -0.83
RDS3Q06835 SRB2YHR041C 633 nt9.77□□□□□ -0.85
RDS3Q06835 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.77□□□□□ -0.85
RDS3Q06835 YJR120WYJR120W 351 nt9.73□□□□□ -0.85
RDS3Q06835 BSC6YOL137W 1494 nt9.7□□□□□ -0.86
RDS3Q06835 BUD23YCR047C 828 nt9.69□□□□□ -0.86
RDS3Q06835 PTC2YER089C 1395 nt9.69□□□□□ -0.86
RDS3Q06835 RPP2BYDR382W 333 nt9.66□□□□□ -0.86
RDS3Q06835 YOR139CYOR139C 393 nt9.65□□□□□ -0.86
RDS3Q06835 WWM1YFL010C 636 nt9.62□□□□□ -0.87
RDS3Q06835 YGR021WYGR021W 873 nt9.61□□□□□ -0.87
RDS3Q06835 HOM6YJR139C 1080 nt9.59□□□□□ -0.87
RDS3Q06835 NAB2YGL122C 1578 nt9.56□□□□□ -0.88
RDS3Q06835 MNP1YGL068W 585 nt9.54□□□□□ -0.88
RDS3Q06835 NPL3YDR432W 1245 nt9.53□□□□□ -0.88
RDS3Q06835 BDH2YAL061W 1254 nt9.51□□□□□ -0.89
RDS3Q06835 INM2YDR287W 879 nt9.49□□□□□ -0.89
RDS3Q06835 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.49□□□□□ -0.89
RDS3Q06835 DAL1YIR027C 1383 nt9.46□□□□□ -0.9
RDS3Q06835 YOL037CYOL037C 354 nt9.45□□□□□ -0.9
RDS3Q06835 FIS1YIL065C 468 nt9.44□□□□□ -0.9
RDS3Q06835 RKM5YLR137W 1104 nt9.44□□□□□ -0.9
RDS3Q06835 FPR4YLR449W 1179 nt9.42□□□□□ -0.9
RDS3Q06835 LSM3YLR438C-A 270 nt9.41□□□□□ -0.9
RDS3Q06835 YBL100CYBL100C 315 nt9.39□□□□□ -0.91
RDS3Q06835 PHO4YFR034C 939 nt9.36□□□□□ -0.91
RDS3Q06835 FUN26YAL022C 1554 nt9.3□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 TRM9YML014W 840 nt9.3□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.28□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.28□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.28□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.28□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.28□□□□□ -0.92
RDS3Q06835 YLR281CYLR281C 468 nt9.22□□□□□ -0.93
RDS3Q06835 CCT6YDR188W 1641 nt9.22□□□□□ -0.93
RDS3Q06835 SPT5YML010W 3192 nt9.2□□□□□ -0.94
RDS3Q06835 WHI5YOR083W 888 nt9.17□□□□□ -0.94
RDS3Q06835 PUS2YGL063W 1113 nt9.16□□□□□ -0.94
RDS3Q06835 YPS1YLR120C 1710 nt9.15□□□□□ -0.94
RDS3Q06835 ALF1YNL148C 765 nt9.13□□□□□ -0.95
RDS3Q06835 YDR095CYDR095C 411 nt9.12□□□□□ -0.95
RDS3Q06835 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.12□□□□□ -0.95
RDS3Q06835 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.12□□□□□ -0.95
RDS3Q06835 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.11□□□□□ -0.95
RDS3Q06835 MEP2YNL142W 1500 nt9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms