RNA–Protein interactions for RNA: YOR229W

WTM2, Transcript of Transcriptional modulator, yeast

Gene WTM2, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WTM2	YOR229W	AIM33	Q04516	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YET3	Q07451	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	UIP4	Q08926	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
WTM2	YOR229W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SPP41	P38904	1435 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SNF3	P10870	884 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ABF1	P14164	731 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SAG1	P20840	650 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	DAL2	P25335	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PHA2	P32452	334 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TRM5	P38793	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YHR078W	P38799	552 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	NVJ1	P38881	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	VFA1	P40080	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CIN1	P40987	1014 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	BAP3	P41815	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	IME4	P41833	600 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YAR1	P46683	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MOG1	P47123	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MRM2	P53123	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YAT1	P80235	687 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ACL4	Q03771	387 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	FMP42	Q04991	504 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YNG1	Q08465	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TMS1	Q12116	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YOP1	Q12402	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	QCR7	P00128	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CDC21	P06785	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PET54	P10834	293 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	GAL3	P13045	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YUR1	P26725	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TIP20	P33891	701 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RIB1	P38066	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ECM31	P38122	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	EHT1	P38295	451 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	POP4	P38336	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RBG1	P39729	369 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	OPT1	P40897	799 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SER2	P42941	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PHO86	P46956	311 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PHB2	P50085	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SPC98	P53540	846 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ZRG17	P53735	605 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ATG4	P53867	494 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MTQ1	P53944	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SNO1	Q03144	224 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TRM82	Q03774	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RIM13	Q03792	727 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CSN9	Q03981	162 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	BUR2	Q05949	395 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MLH3	Q12083	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	BNR1	P40450	1375 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	HTB2	P02294	131 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ATG22	P25568	528 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ECM13	P38195	257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	LDB7	P38210	180 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	LEU5	P38702	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PFS1	P38872	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YER130C	P39959	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CSM2	P40465	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	GUF1	P46943	645 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	BIT61	P47041	543 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YPT11	P48559	417 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RFX1	P48743	811 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YNL260C	P53846	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	VHS1	Q03785	461 aa		4.78	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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